More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3496 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 407 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  91.87 
 
 		 410 aa  767    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  70.71 
 
 		 421 aa  584  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  58.25 
 
 		 404 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  39.15 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  37.98 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  38.34 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  37.76 
 
 		 464 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  38.8 
 
 		 465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  32.49 
 
 		 450 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 517 aa  209  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.96 
 
 		 466 aa  207  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  34.89 
 
 		 401 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.36 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  38.48 
 
 		 427 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  32.75 
 
 		 494 aa  206  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  36.1 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  36.43 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  34.28 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 		 424 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  32.2 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  33.96 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 		 420 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  35.07 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 		 348 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  31.88 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 		 405 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 		 405 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  32.14 
 
 		 367 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.67 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  40.19 
 
 		 439 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.38 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.62 
 
 		 614 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.8 
 
 		 638 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 632 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  37.57 
 
 		 483 aa  119  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.24 
 
 		 500 aa  119  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.18 
 
 		 585 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 		 858 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  35.32 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  40.98 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.46 
 
 		 650 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  36.92 
 
 		 641 aa  114  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 		 859 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.8 
 
 		 903 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  36.21 
 
 		 577 aa  111  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  38.33 
 
 		 645 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 		 864 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  34.78 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 911 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  37.24 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  34.78 
 
 		 571 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.91 
 
 		 652 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.18 
 
 		 971 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  25.61 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.64 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 		 860 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 		 861 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  24.91 
 
 		 431 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.37 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 		 735 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  25.21 
 
 		 641 aa  101  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.39 
 
 		 757 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.84 
 
 		 672 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.43 
 
 		 465 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.23 
 
 		 701 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.52 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 		 665 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  34.88 
 
 		 546 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  36.47 
 
 		 969 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 		 591 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.26 
 
 		 656 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.11 
 
 		 637 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 744 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  29.22 
 
 		 636 aa  97.4  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  28.85 
 
 		 701 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 		 528 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.62 
 
 		 607 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 		 528 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 741 aa  97.8  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 		 528 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  36.09 
 
 		 558 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 		 643 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 		 284 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 699 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  42.03 
 
 		 564 aa  96.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  31.66 
 
 		 632 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 		 464 aa  96.3  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  33.12 
 
 		 712 aa  96.3  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>