More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0773 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 		 465 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  72.26 
 
 		 464 aa  675    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  39.35 
 
 		 404 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 399 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.7 
 
 		 421 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  38.14 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  38.8 
 
 		 407 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  37.76 
 
 		 410 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  35.62 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 494 aa  200  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  34.66 
 
 		 450 aa  199  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  36.88 
 
 		 517 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  34.35 
 
 		 424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  34.24 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  36.5 
 
 		 416 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  35.84 
 
 		 426 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 400 aa  183  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.43 
 
 		 411 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  35.16 
 
 		 388 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 		 411 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  35.04 
 
 		 348 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  35.49 
 
 		 405 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  33.69 
 
 		 406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  35.13 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 401 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  34.72 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 		 406 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  37.43 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 401 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  35.54 
 
 		 427 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.03 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 		 424 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  46.05 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  37.16 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 		 420 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  40.54 
 
 		 641 aa  124  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.04 
 
 		 650 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  35.79 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  37.85 
 
 		 858 aa  107  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  36.17 
 
 		 864 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.39 
 
 		 1133 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  36.72 
 
 		 859 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 		 735 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.14 
 
 		 903 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  34.18 
 
 		 1207 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.66 
 
 		 911 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.5 
 
 		 652 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 		 284 aa  100  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.51 
 
 		 1130 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.51 
 
 		 440 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  39.73 
 
 		 591 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32 
 
 		 638 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.74 
 
 		 723 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.7 
 
 		 672 aa  99.8  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.11 
 
 		 656 aa  99.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  31.17 
 
 		 614 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 		 699 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.48 
 
 		 723 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.03 
 
 		 632 aa  99  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.84 
 
 		 757 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  31.22 
 
 		 483 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  32.41 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  41.27 
 
 		 586 aa  97.8  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  31.22 
 
 		 483 aa  97.1  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  32.56 
 
 		 441 aa  96.7  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  33.49 
 
 		 725 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  37.56 
 
 		 585 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  34.82 
 
 		 667 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  35.75 
 
 		 577 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.58 
 
 		 696 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  33.05 
 
 		 744 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.81 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 645 aa  94  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.1 
 
 		 643 aa  93.2  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 348 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.52 
 
 		 861 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 		 860 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.58 
 
 		 703 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  37.65 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.53 
 
 		 737 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.33 
 
 		 754 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 		 1805 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  28.93 
 
 		 701 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.83 
 
 		 607 aa  90.5  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  30.1 
 
 		 702 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  30.18 
 
 		 636 aa  90.1  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1502  adenylate/guanylate cyclase  36.6 
 
 		 561 aa  89.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000770351  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  36.67 
 
 		 632 aa  89.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.02 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  32.97 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.25 
 
 		 694 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.92 
 
 		 701 aa  88.2  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>