More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0986 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
400 aa  796    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  52.87 
 
 
411 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  52.91 
 
 
411 aa  410  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  52.88 
 
 
427 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  42.98 
 
 
348 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.11 
 
 
421 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.1 
 
 
399 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  36.43 
 
 
410 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  36.43 
 
 
407 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  32.64 
 
 
447 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
447 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 
401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
391 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 
464 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  37.96 
 
 
404 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  32.03 
 
 
450 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
405 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 
405 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
399 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  30.75 
 
 
494 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  32.49 
 
 
424 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
517 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.09 
 
 
406 aa  182  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
465 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  35.17 
 
 
425 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  35.49 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  37.16 
 
 
379 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
388 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  34.46 
 
 
416 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  31.48 
 
 
381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  33.6 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.6 
 
 
466 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 
401 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 
406 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
401 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  43.06 
 
 
370 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  33.59 
 
 
426 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  40.25 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  42.65 
 
 
367 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
420 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
903 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.47 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 
641 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.88 
 
 
645 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 
860 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
591 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  33.75 
 
 
675 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.05 
 
 
861 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.33 
 
 
614 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.16 
 
 
678 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  28.16 
 
 
636 aa  102  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.12 
 
 
735 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.57 
 
 
441 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.24 
 
 
483 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26.15 
 
 
641 aa  100  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  32.29 
 
 
638 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  32.69 
 
 
585 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.15 
 
 
500 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  39.15 
 
 
440 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  27.86 
 
 
483 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  28.15 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  29.75 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  34.55 
 
 
651 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 
643 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  30.25 
 
 
746 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  36.18 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.14 
 
 
656 aa  97.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.46 
 
 
701 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.63 
 
 
757 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.88 
 
 
584 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  27.55 
 
 
701 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  30.54 
 
 
643 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  25.81 
 
 
859 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.52 
 
 
650 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 
911 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  27.48 
 
 
284 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.78 
 
 
465 aa  94  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.11 
 
 
971 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.95 
 
 
584 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.91 
 
 
969 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.51 
 
 
672 aa  93.2  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  37.57 
 
 
439 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
586 aa  93.2  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 
699 aa  93.2  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.05 
 
 
652 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  33.53 
 
 
648 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.09 
 
 
637 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  35.03 
 
 
577 aa  91.3  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 
744 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.74 
 
 
645 aa  91.3  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 
858 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
741 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.04 
 
 
725 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.62 
 
 
756 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  29.74 
 
 
712 aa  90.5  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  28.5 
 
 
702 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  30.77 
 
 
632 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  32.49 
 
 
725 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  30.32 
 
 
523 aa  89.4  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>