More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7519 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  90.62 
 
 
416 aa  768    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
426 aa  857    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  70.36 
 
 
466 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  71.32 
 
 
424 aa  560  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  70.28 
 
 
396 aa  558  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  70.07 
 
 
425 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  37.53 
 
 
401 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  37.08 
 
 
401 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  35.77 
 
 
388 aa  219  7e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.07 
 
 
399 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.01 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  34.91 
 
 
404 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  35.17 
 
 
410 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  37.64 
 
 
379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
391 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  34.13 
 
 
420 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 
407 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
464 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
517 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  34.44 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 
406 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
424 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.84 
 
 
465 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 
405 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.43 
 
 
411 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 
411 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 
401 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  34.14 
 
 
381 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  29.58 
 
 
450 aa  156  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 
447 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  33.5 
 
 
400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  27.94 
 
 
447 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 
427 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  31.59 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  28.9 
 
 
494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  30.45 
 
 
370 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  37.44 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  41.36 
 
 
483 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 
367 aa  106  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  37.77 
 
 
667 aa  99.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 
911 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
740 aa  97.8  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35 
 
 
465 aa  96.7  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  38.46 
 
 
859 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.34 
 
 
864 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  43.14 
 
 
431 aa  96.3  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 
858 aa  95.9  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  39.01 
 
 
586 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
860 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  31.55 
 
 
483 aa  93.2  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  31.82 
 
 
483 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.07 
 
 
440 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  41.1 
 
 
694 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  38.56 
 
 
696 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  38.85 
 
 
437 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  38.85 
 
 
437 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 
348 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
632 aa  91.3  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
741 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.15 
 
 
1133 aa  90.1  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  30.3 
 
 
607 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.24 
 
 
652 aa  89.7  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.08 
 
 
701 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 
284 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
861 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  34.71 
 
 
358 aa  89  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  35.81 
 
 
364 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  37.58 
 
 
532 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  33.5 
 
 
348 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.17 
 
 
737 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.99 
 
 
658 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.7 
 
 
1130 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  39.74 
 
 
571 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.93 
 
 
701 aa  87.8  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.8 
 
 
971 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  33.54 
 
 
701 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.33 
 
 
638 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  32.27 
 
 
645 aa  86.7  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.62 
 
 
797 aa  86.7  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 
546 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.58 
 
 
650 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.88 
 
 
614 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  29.83 
 
 
632 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  29.19 
 
 
637 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 
969 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  36.59 
 
 
514 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  32.11 
 
 
1119 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  34.27 
 
 
645 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  36.24 
 
 
903 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
641 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  30.9 
 
 
729 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 
479 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  35.33 
 
 
1020 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.53 
 
 
678 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 
593 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  37.01 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>