More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0582 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  81.28 
 
 		 396 aa  634    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 425 aa  852    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  92.23 
 
 		 466 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  92.23 
 
 		 424 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  71.29 
 
 		 416 aa  586  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  70.07 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  40.61 
 
 		 401 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  39.85 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.96 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 410 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  36.27 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  38.71 
 
 		 379 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  36.81 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 		 388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.13 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  37.13 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  35.4 
 
 		 391 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  35.09 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  33 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 424 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  32.89 
 
 		 517 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 		 447 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  35.17 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  29.97 
 
 		 450 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  30.63 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.34 
 
 		 411 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  32.53 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.83 
 
 		 405 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  35.34 
 
 		 411 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  34.34 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.58 
 
 		 405 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.43 
 
 		 348 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.29 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  32.72 
 
 		 381 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  31.47 
 
 		 367 aa  121  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.97 
 
 		 483 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  38.25 
 
 		 740 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.21 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  41.27 
 
 		 439 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.24 
 
 		 465 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  37.04 
 
 		 632 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  41.03 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.87 
 
 		 911 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.28 
 
 		 637 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 607 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  34.29 
 
 		 643 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 		 860 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  34.73 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.73 
 
 		 483 aa  95.5  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.14 
 
 		 658 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  32.64 
 
 		 614 aa  93.6  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  39.42 
 
 		 364 aa  93.2  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  33.54 
 
 		 701 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.92 
 
 		 741 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.08 
 
 		 585 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.34 
 
 		 672 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.32 
 
 		 701 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  34.18 
 
 		 971 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 		 712 aa  90.5  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.68 
 
 		 696 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  31.58 
 
 		 358 aa  90.1  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.98 
 
 		 737 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 859 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.84 
 
 		 656 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 638 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  30 
 
 		 645 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  29.44 
 
 		 1133 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.96 
 
 		 858 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  31.64 
 
 		 729 aa  87.4  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  37.89 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  38.01 
 
 		 514 aa  87.4  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.24 
 
 		 611 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 		 861 aa  87  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 591 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  33.15 
 
 		 593 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.08 
 
 		 652 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  31.19 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  30.73 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  36.61 
 
 		 586 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 		 1119 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  35.33 
 
 		 571 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  28.43 
 
 		 1130 aa  84  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  32.3 
 
 		 1805 aa  83.6  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  29.36 
 
 		 744 aa  83.6  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  31.07 
 
 		 636 aa  83.2  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  32.62 
 
 		 903 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.69 
 
 		 797 aa  83.2  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.57 
 
 		 701 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.33 
 
 		 969 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  30.43 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1735  adenylate/guanylate cyclase  35.96 
 
 		 564 aa  82.8  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240199  hitchhiker  0.00356206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.51 
 
 		 650 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.71 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  28.21 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.7 
 
 		 667 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>