More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6772 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 416 aa  835    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  90.62 
 
 		 426 aa  768    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  71.29 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  69.51 
 
 		 396 aa  559  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  69.4 
 
 		 466 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  70.34 
 
 		 424 aa  555  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  38.38 
 
 		 401 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  36.03 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.55 
 
 		 399 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  36.58 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  35.53 
 
 		 410 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  37.1 
 
 		 379 aa  202  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  36.34 
 
 		 421 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  34.39 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  34.3 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 		 464 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 		 517 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 		 406 aa  183  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 		 406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  32.87 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.5 
 
 		 465 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.72 
 
 		 411 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33.25 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 		 400 aa  166  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  31.86 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  29.72 
 
 		 450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 381 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  32.09 
 
 		 427 aa  155  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  29.85 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 367 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.26 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  38.22 
 
 		 483 aa  107  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  38.81 
 
 		 586 aa  99.8  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 		 911 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.2 
 
 		 465 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 		 859 aa  98.6  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.2 
 
 		 440 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  37.82 
 
 		 740 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 		 860 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  43.14 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  38.07 
 
 		 439 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  39.1 
 
 		 858 aa  96.7  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  37.66 
 
 		 864 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.63 
 
 		 696 aa  95.1  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 		 1133 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  31.31 
 
 		 607 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  40.27 
 
 		 694 aa  93.6  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  35.03 
 
 		 348 aa  93.6  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  33.93 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  34.13 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  38.22 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0710  hypothetical protein  38.22 
 
 		 437 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 		 861 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  35.12 
 
 		 741 aa  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  29.6 
 
 		 1130 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.74 
 
 		 284 aa  90.9  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  37.95 
 
 		 667 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 638 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  35.88 
 
 		 358 aa  90.5  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  35.29 
 
 		 797 aa  90.1  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.52 
 
 		 737 aa  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 459 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.97 
 
 		 701 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.16 
 
 		 658 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  33.87 
 
 		 614 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 		 1119 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 645 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.87 
 
 		 650 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 		 532 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  38.69 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.24 
 
 		 652 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 		 632 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 641 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 		 903 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  26.94 
 
 		 441 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.8 
 
 		 971 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.27 
 
 		 637 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  32.93 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  33.54 
 
 		 701 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  31.94 
 
 		 643 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.57 
 
 		 678 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  26.6 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 		 546 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  35.2 
 
 		 645 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 		 746 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.02 
 
 		 729 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  31.82 
 
 		 936 aa  84.3  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  36.88 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  31.22 
 
 		 969 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>