More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4896 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 401 aa  822    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  47.49 
 
 		 406 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  46.94 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  46.94 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  44.67 
 
 		 424 aa  356  2.9999999999999997e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  35.45 
 
 		 381 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 		 399 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  32.05 
 
 		 450 aa  195  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 447 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  32.66 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  29.26 
 
 		 447 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  34.28 
 
 		 464 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 		 348 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  34.5 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.24 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 		 421 aa  176  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.71 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 		 411 aa  172  9e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  32.32 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  30.96 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 		 391 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  30.46 
 
 		 424 aa  163  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.46 
 
 		 466 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  30.36 
 
 		 426 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  28.61 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  29.85 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  38.53 
 
 		 367 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  28.1 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  28.1 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 		 367 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  27.93 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  27.64 
 
 		 420 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.23 
 
 		 861 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 		 483 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 860 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  39.26 
 
 		 591 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.88 
 
 		 632 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.12 
 
 		 614 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  29.9 
 
 		 701 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 		 859 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.81 
 
 		 585 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  33.97 
 
 		 488 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  27.19 
 
 		 641 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  30 
 
 		 701 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  26.54 
 
 		 636 aa  90.1  6e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.1 
 
 		 500 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  32.5 
 
 		 632 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  28.84 
 
 		 858 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 		 911 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 364 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.81 
 
 		 584 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.69 
 
 		 650 aa  86.7  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  24.88 
 
 		 638 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.9 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.06 
 
 		 737 aa  85.9  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  24.9 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  26.84 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.81 
 
 		 584 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.79 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 		 864 aa  84.7  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.28 
 
 		 672 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 		 759 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  30.27 
 
 		 645 aa  83.2  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5259  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.78 
 
 		 696 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 		 741 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.8 
 
 		 725 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  31.19 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.56 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  25.73 
 
 		 643 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.56 
 
 		 764 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  26.61 
 
 		 746 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  25.73 
 
 		 637 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  25.98 
 
 		 643 aa  80.5  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 		 734 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  28.71 
 
 		 667 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.84 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.98 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.34 
 
 		 658 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.3 
 
 		 645 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.02 
 
 		 465 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 		 699 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  28.05 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 903 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 		 1172 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>