More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3196 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
406 aa  809    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  37.34 
 
 
391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  33.67 
 
 
399 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
399 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  34.51 
 
 
388 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  35.23 
 
 
379 aa  192  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  35 
 
 
416 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 
396 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  32.55 
 
 
464 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  31.95 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  34.17 
 
 
426 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  32.45 
 
 
517 aa  177  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  32.77 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.77 
 
 
466 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.07 
 
 
465 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  30.98 
 
 
407 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
420 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  33.51 
 
 
401 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 
410 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  32.32 
 
 
411 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
405 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
447 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  30.71 
 
 
421 aa  168  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  31.42 
 
 
405 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.88 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  32.04 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
447 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  36.98 
 
 
370 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  31.79 
 
 
400 aa  159  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  30.85 
 
 
427 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 
367 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  31.3 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 
424 aa  146  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  32.69 
 
 
348 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  34.54 
 
 
367 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 
494 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  33.47 
 
 
632 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.08 
 
 
650 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  34.88 
 
 
483 aa  99.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 
643 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  28.33 
 
 
614 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  31.92 
 
 
1172 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  27.18 
 
 
358 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 
651 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  27.73 
 
 
348 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  32.26 
 
 
584 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  28.69 
 
 
607 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  36.65 
 
 
500 aa  87  5e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  27.93 
 
 
701 aa  87  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  26.91 
 
 
864 aa  86.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  29.76 
 
 
797 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  38.04 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.61 
 
 
696 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.7 
 
 
641 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  31.67 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  26.72 
 
 
702 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  28.96 
 
 
645 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 
858 aa  84  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2382  putative adenylate/guanylate cyclase  37.36 
 
 
488 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.627426  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.44 
 
 
678 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.46 
 
 
643 aa  83.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.04 
 
 
577 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.2 
 
 
859 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.82 
 
 
701 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
713 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  31.63 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 
903 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  33.93 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  32.98 
 
 
971 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  25.97 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  31.39 
 
 
684 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.11 
 
 
638 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  29.22 
 
 
536 aa  80.5  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  30.22 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.35 
 
 
637 aa  80.1  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.97 
 
 
611 aa  80.1  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4265  putative adenylate/guanylate cyclase  36.16 
 
 
488 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  21.88 
 
 
641 aa  79.7  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  26.26 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 
860 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 
735 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1207 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  26.26 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.12 
 
 
632 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  31.58 
 
 
645 aa  79  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  29.65 
 
 
981 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  32.67 
 
 
746 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.96 
 
 
757 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  29.57 
 
 
667 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
744 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5604  adenylate cyclase  33.69 
 
 
571 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.85 
 
 
1134 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 
861 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
740 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  35.41 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>