More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0662 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  61.04 
 
 
1133 aa  1330    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1130 aa  2318    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  44.77 
 
 
1119 aa  912    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  62.59 
 
 
1207 aa  1309    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 
937 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  48.95 
 
 
1526 aa  406  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  40.07 
 
 
1111 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  39.11 
 
 
1128 aa  363  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  40.31 
 
 
1127 aa  362  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  39.25 
 
 
1177 aa  360  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  42.03 
 
 
1018 aa  324  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.2 
 
 
1096 aa  301  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  38.37 
 
 
608 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  38.37 
 
 
608 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  38.72 
 
 
1016 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  46.49 
 
 
1805 aa  261  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
687 aa  247  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.59 
 
 
1274 aa  244  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  36.43 
 
 
872 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
631 aa  242  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
970 aa  241  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
944 aa  241  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  35.08 
 
 
1022 aa  240  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
1853 aa  240  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.01 
 
 
853 aa  240  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
1479 aa  239  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 
1172 aa  239  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
916 aa  238  5.0000000000000005e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.5 
 
 
1130 aa  237  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1037  sensor histidine kinase/response regulator  37.77 
 
 
896 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  33.62 
 
 
967 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  33.62 
 
 
967 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0900  sensor histidine kinase  38.37 
 
 
896 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.73 
 
 
1843 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1072  sensor histidine kinase/response regulator  37.56 
 
 
896 aa  235  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.88167e-43 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 
597 aa  234  5e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07038  histidine kinase  32.93 
 
 
641 aa  234  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
977 aa  234  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0917  sensor histidine kinase  37.32 
 
 
896 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4266  sensor histidine kinase/response regulator  36.88 
 
 
896 aa  232  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
674 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  38.2 
 
 
1346 aa  232  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
835 aa  232  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
922 aa  232  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3009  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.17 
 
 
920 aa  231  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.59521  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1847 aa  231  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.18 
 
 
659 aa  231  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  32.13 
 
 
968 aa  231  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0144  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1119 aa  231  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0932  sensor histidine kinase/response regulator  36.83 
 
 
896 aa  230  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
1406 aa  230  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0996  sensor histidine kinase/response regulator  36.83 
 
 
896 aa  230  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
823 aa  230  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1163  sensor histidine kinase/response regulator  37.1 
 
 
896 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1090  sensor histidine kinase/response regulator  37.62 
 
 
896 aa  229  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.358618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  33.13 
 
 
620 aa  229  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  36.9 
 
 
544 aa  229  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
870 aa  229  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 
1127 aa  228  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0876  response regulator receiver  32.72 
 
 
526 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183507 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.37 
 
 
858 aa  228  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 
1070 aa  228  5.0000000000000005e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  33.99 
 
 
528 aa  227  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
1195 aa  227  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
646 aa  226  1e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35.92 
 
 
882 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.16 
 
 
631 aa  225  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
932 aa  225  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0907  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
896 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  29.15 
 
 
910 aa  224  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  35.77 
 
 
772 aa  224  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1214 aa  224  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1267  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.56 
 
 
916 aa  224  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 
944 aa  224  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 
1156 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  31.95 
 
 
835 aa  222  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
962 aa  222  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
902 aa  222  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2393  histidine kinase  35.92 
 
 
735 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.774182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.9 
 
 
846 aa  222  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
785 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4154  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 
750 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.22479  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  36.22 
 
 
588 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
645 aa  221  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 
827 aa  221  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
1180 aa  221  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
717 aa  220  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  35.91 
 
 
661 aa  219  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  32.07 
 
 
730 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  34.84 
 
 
845 aa  219  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.01 
 
 
763 aa  219  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
995 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  36.07 
 
 
802 aa  219  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  34.4 
 
 
845 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
1362 aa  218  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.57 
 
 
907 aa  218  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  32.71 
 
 
1361 aa  218  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3821  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
759 aa  218  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6993  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1159 aa  218  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.922616  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1452 aa  218  7e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>