207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4130 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
348 aa  674    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  64.33 
 
 
357 aa  367  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  45.28 
 
 
346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  42.6 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  40.06 
 
 
334 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  39.26 
 
 
336 aa  205  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  40.73 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  40.7 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  40.06 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 
424 aa  192  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  40.18 
 
 
435 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  39 
 
 
374 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  38.12 
 
 
335 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  41.75 
 
 
371 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  38.48 
 
 
379 aa  175  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  38.51 
 
 
373 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.65 
 
 
332 aa  170  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  35.45 
 
 
404 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  36.91 
 
 
400 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 
345 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  34.56 
 
 
350 aa  153  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  36.23 
 
 
362 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  36.77 
 
 
364 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
373 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  29.63 
 
 
378 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  27.9 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  31.13 
 
 
369 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  38.17 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  30.72 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  36.64 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  40.72 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  40.72 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  36.59 
 
 
273 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  40.12 
 
 
373 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 
425 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
308 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  26.97 
 
 
294 aa  63.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
643 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  33.33 
 
 
1122 aa  62  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  34.96 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
664 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2492  adenylate cyclase  32.26 
 
 
313 aa  59.7  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.679793 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  37.9 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  31.43 
 
 
667 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  27.91 
 
 
275 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  31.03 
 
 
275 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 
738 aa  57.4  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
652 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  35.85 
 
 
203 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  33.55 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 
310 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11641  membrane-anchored adenylyl cyclase cya  27.23 
 
 
443 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
860 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
536 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  31.08 
 
 
1065 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2634  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.3 
 
 
226 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  25.17 
 
 
861 aa  53.9  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  27.88 
 
 
584 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5448  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.25 
 
 
629 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296082 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  31.76 
 
 
465 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
523 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1855  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 
275 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527311  normal  0.269259 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  26.92 
 
 
584 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.26 
 
 
577 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  21.95 
 
 
591 aa  52  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.21 
 
 
622 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
746 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.86 
 
 
611 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0534  adenylate/guanylate cyclase  28.75 
 
 
642 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397996  normal  0.0249995 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3652  putative adenylate/guanylate cyclase  31.11 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.274085  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  29.48 
 
 
1123 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  26.64 
 
 
1172 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  25.57 
 
 
702 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.63 
 
 
289 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3576  putative adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0204141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  24.73 
 
 
859 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  24.12 
 
 
1130 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  36.04 
 
 
1392 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8980  Adenylate cyclase family 3 (some protein contain HAMP domain)-like protein  26.47 
 
 
684 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 
817 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6629  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.78 
 
 
568 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.93 
 
 
672 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0089  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
647 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  24.12 
 
 
1133 aa  49.3  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.58 
 
 
622 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 
633 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.64 
 
 
1037 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.54 
 
 
656 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5906  putative adenylate cyclase 3  34.11 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0410  putative adenylate cyclase  29.46 
 
 
553 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  22.37 
 
 
911 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.82 
 
 
665 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>