209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3492 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  100 
 
 
335 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  42.86 
 
 
435 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1285  putative adenylate/guanylate cyclase  36.39 
 
 
424 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0817591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  42.55 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  36.94 
 
 
374 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  40.12 
 
 
337 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  40.86 
 
 
348 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  36.84 
 
 
334 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  39.18 
 
 
346 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  37.73 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  35.67 
 
 
379 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  34.92 
 
 
404 aa  170  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25420  family 3 adenylate cyclase  37.97 
 
 
362 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0567638  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  37.22 
 
 
334 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0212  adenylate/guanylate cyclase  34.05 
 
 
337 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.57 
 
 
332 aa  162  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  38.12 
 
 
348 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
345 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
357 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  33.91 
 
 
350 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  35.94 
 
 
400 aa  155  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 
364 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1043  adenylate/guanylate cyclase  34.59 
 
 
373 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  36.86 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12240  hypothetical protein  32.18 
 
 
378 aa  103  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.467322  normal  0.176124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4672  adenylate/guanylate cyclase  32.48 
 
 
373 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2243  putative adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
369 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4452  putative adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11290  adenylyl cyclase (ATP pyrophosphate-lyase)  30.39 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0147035  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  29.79 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1670  adenylate/guanylate cyclase  30.22 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3963  putative adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
373 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.976372  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3949  adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.974528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4023  putative adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0400428  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
1046 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5374  putative adenylate/guanylate cyclase  34.01 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2823  putative adenylate/guanylate cyclase  34.62 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5675  putative adenylate/guanylate cyclase  34.53 
 
 
273 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.895326 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  33.49 
 
 
1055 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
1105 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3699  putative adenylate/guanylate cyclase  34.43 
 
 
273 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0146581  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  31.95 
 
 
1122 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3080  putative adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17288  normal  0.300362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 
665 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
1027 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.39 
 
 
1027 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  28.81 
 
 
301 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  29.59 
 
 
1048 aa  60.1  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  29.9 
 
 
1027 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1766  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.37 
 
 
591 aa  59.3  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  31.61 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  28.85 
 
 
308 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1571  adenylate/guanylate cyclase  31.95 
 
 
426 aa  58.5  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000352613  hitchhiker  0.00000380859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3539  adenylate/guanylate cyclase  33.81 
 
 
304 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5737  putative adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 
216 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  29.76 
 
 
523 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  32.03 
 
 
1065 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2195  adenylate/guanylate cyclase  30.77 
 
 
255 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.094605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  33.08 
 
 
304 aa  56.6  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.51 
 
 
1160 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0533  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
422 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.549362  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
758 aa  56.2  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
449 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
449 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
449 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.61 
 
 
1080 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  26.37 
 
 
1172 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
310 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.66 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.29 
 
 
1087 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1377  adenylate cyclase  31.2 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5336  putative adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
203 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0850  adenylate/guanylate cyclase  27.33 
 
 
278 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000130568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2493  adenylate/guanylate cyclase  29.95 
 
 
255 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  28.16 
 
 
472 aa  53.5  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.77 
 
 
1291 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  27.11 
 
 
275 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 
1156 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.75 
 
 
643 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  30.43 
 
 
299 aa  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  31.85 
 
 
546 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0115  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
472 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1561  adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 
417 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  25.73 
 
 
460 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.54 
 
 
1180 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 
735 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48678  predicted protein  29.68 
 
 
806 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
1123 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4853  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.88 
 
 
289 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28.34 
 
 
518 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  24.86 
 
 
738 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.66 
 
 
1358 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
515 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  24.83 
 
 
441 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  24.83 
 
 
431 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 
746 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
1096 aa  50.1  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>