More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4524 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 1105 aa  2241    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  35.2 
 
 		 1122 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  32.57 
 
 		 1048 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 		 1148 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  32.34 
 
 		 1139 aa  522  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  33.87 
 
 		 1037 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 		 1151 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.84 
 
 		 1151 aa  516  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  33.19 
 
 		 1138 aa  496  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.78 
 
 		 1149 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.91 
 
 		 1141 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  31.77 
 
 		 1377 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  34.09 
 
 		 1043 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 		 1065 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  38.78 
 
 		 1175 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  32.01 
 
 		 1403 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.71 
 
 		 1117 aa  367  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.16 
 
 		 1046 aa  363  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  35.6 
 
 		 1227 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  29.41 
 
 		 1055 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 1402 aa  337  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 1398 aa  328  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 		 1093 aa  291  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.77 
 
 		 1133 aa  270  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.87 
 
 		 1291 aa  268  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.7 
 
 		 1089 aa  264  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.65 
 
 		 1160 aa  264  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.13 
 
 		 1023 aa  261  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.92 
 
 		 1134 aa  260  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.93 
 
 		 1311 aa  253  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.88 
 
 		 1081 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.66 
 
 		 1055 aa  249  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.44 
 
 		 1080 aa  248  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  26.94 
 
 		 1358 aa  239  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  28.55 
 
 		 1050 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.55 
 
 		 1050 aa  235  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1027 aa  234  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1027 aa  234  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.3 
 
 		 1126 aa  230  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.85 
 
 		 1027 aa  228  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  26.46 
 
 		 1349 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.27 
 
 		 1063 aa  222  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  26.74 
 
 		 1348 aa  222  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 		 1123 aa  218  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 1342 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 1349 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  26.53 
 
 		 1349 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.93 
 
 		 1087 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.69 
 
 		 1053 aa  213  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.81 
 
 		 1429 aa  213  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.68 
 
 		 1142 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  25.89 
 
 		 1353 aa  202  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.78 
 
 		 1441 aa  201  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 		 1094 aa  197  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.5 
 
 		 1422 aa  197  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.37 
 
 		 1067 aa  196  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  28.13 
 
 		 914 aa  192  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.52 
 
 		 1360 aa  192  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.15 
 
 		 1014 aa  185  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  28.11 
 
 		 1198 aa  184  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1213 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1359 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1350 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1359 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1359 aa  182  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 1359 aa  182  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 		 1359 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 		 1271 aa  177  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.36 
 
 		 1403 aa  177  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1298 aa  171  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.93 
 
 		 1295 aa  169  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.05 
 
 		 1096 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 		 956 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  24.82 
 
 		 1289 aa  144  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  22.34 
 
 		 1153 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 1022 aa  137  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 973 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  25.23 
 
 		 1204 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.55 
 
 		 1264 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.95 
 
 		 1034 aa  131  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.11 
 
 		 1190 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.34 
 
 		 1169 aa  127  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 		 1285 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.7 
 
 		 1226 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.41 
 
 		 805 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  25.79 
 
 		 1118 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 1015 aa  118  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  23.63 
 
 		 1130 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.81 
 
 		 967 aa  115  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.74 
 
 		 916 aa  113  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.57 
 
 		 1006 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  26.27 
 
 		 992 aa  112  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.96 
 
 		 959 aa  112  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.49 
 
 		 1020 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.94 
 
 		 954 aa  110  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 966 aa  109  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 999 aa  108  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 320 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  28.72 
 
 		 320 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  25.73 
 
 		 1340 aa  107  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>