294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0078 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  100 
 
 
914 aa  1764    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  44.69 
 
 
1133 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29 
 
 
1227 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  31 
 
 
1122 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  28.84 
 
 
1105 aa  198  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.84 
 
 
1175 aa  194  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  29.09 
 
 
1048 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.95 
 
 
1043 aa  171  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.7 
 
 
1065 aa  164  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.94 
 
 
1055 aa  161  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.81 
 
 
1134 aa  159  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
1046 aa  154  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 
1403 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  27.34 
 
 
1037 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  29.18 
 
 
1377 aa  136  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.86 
 
 
1398 aa  136  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.71 
 
 
1422 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.2 
 
 
1429 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.36 
 
 
1402 aa  128  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.07 
 
 
1160 aa  127  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.38 
 
 
1358 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.51 
 
 
1403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.1 
 
 
1141 aa  121  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  29.47 
 
 
1349 aa  121  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
1148 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  29 
 
 
1348 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.04 
 
 
1149 aa  118  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1139 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  25.74 
 
 
1138 aa  114  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31 
 
 
1023 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
1349 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 
1349 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.9 
 
 
1081 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
1311 aa  112  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.45 
 
 
1087 aa  112  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.25 
 
 
1291 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  27.68 
 
 
1027 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.92 
 
 
1264 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  29.32 
 
 
1353 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  30.34 
 
 
1342 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1198 aa  108  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.63 
 
 
1080 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
956 aa  108  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 
1027 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  28.14 
 
 
1027 aa  108  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.85 
 
 
1089 aa  107  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.13 
 
 
1117 aa  106  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.96 
 
 
1151 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  29.73 
 
 
1213 aa  101  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  30.16 
 
 
1359 aa  101  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  29.98 
 
 
1350 aa  101  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  29.98 
 
 
1359 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
1359 aa  101  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  29.98 
 
 
1359 aa  101  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  29.79 
 
 
1359 aa  100  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.78 
 
 
1151 aa  99.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.86 
 
 
1053 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
1400 aa  95.5  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0817  transcriptional regulator, SARP family  50 
 
 
117 aa  95.1  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.686182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 
983 aa  95.1  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 
1383 aa  95.1  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
1360 aa  94.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  25.62 
 
 
1050 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  27.49 
 
 
982 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.62 
 
 
1050 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
1422 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  25.9 
 
 
1298 aa  92.8  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.7 
 
 
967 aa  91.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
973 aa  90.5  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.46 
 
 
1441 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 
954 aa  90.9  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  27.56 
 
 
1320 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  29.42 
 
 
1340 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.54 
 
 
1006 aa  90.1  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.98 
 
 
992 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 
900 aa  90.1  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.65 
 
 
1022 aa  90.1  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.76 
 
 
1142 aa  89.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  21.36 
 
 
1093 aa  89.4  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.89 
 
 
916 aa  88.2  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.15 
 
 
959 aa  88.2  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.1 
 
 
1067 aa  87  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  27.74 
 
 
1289 aa  87  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 
970 aa  87.4  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  25.46 
 
 
1169 aa  86.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 
967 aa  85.5  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  24.68 
 
 
1094 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.29 
 
 
1123 aa  85.1  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.22 
 
 
993 aa  84.7  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.78 
 
 
1468 aa  84.7  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.93 
 
 
1075 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  32.26 
 
 
1116 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.13 
 
 
1029 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 
1029 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.36 
 
 
1271 aa  81.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.95 
 
 
998 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.75 
 
 
713 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  28.24 
 
 
1050 aa  80.1  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  28.61 
 
 
928 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 
966 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>