More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5181 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  37.51 
 
 
1175 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1227 aa  2479    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  42.88 
 
 
1122 aa  525  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  39.41 
 
 
1048 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  35.6 
 
 
1105 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  37.2 
 
 
1043 aa  363  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  36.03 
 
 
1403 aa  362  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  33.9 
 
 
1055 aa  363  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
1046 aa  353  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  36.05 
 
 
1065 aa  335  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  32.81 
 
 
1037 aa  321  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 
1139 aa  292  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.46 
 
 
1141 aa  290  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  30.97 
 
 
1148 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.15 
 
 
1089 aa  286  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.08 
 
 
1149 aa  277  9e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1138 aa  277  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.69 
 
 
1151 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.84 
 
 
1160 aa  274  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.37 
 
 
1151 aa  274  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.49 
 
 
1134 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.12 
 
 
1291 aa  253  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.58 
 
 
1081 aa  253  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.95 
 
 
1080 aa  252  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 
1402 aa  248  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.47 
 
 
1377 aa  247  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.63 
 
 
1093 aa  246  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  30.42 
 
 
1063 aa  239  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.73 
 
 
1198 aa  239  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
1360 aa  237  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.06 
 
 
1429 aa  237  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
1094 aa  237  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.53 
 
 
1142 aa  235  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.07 
 
 
1117 aa  234  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.52 
 
 
1403 aa  230  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
1050 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.34 
 
 
1050 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.72 
 
 
1422 aa  228  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30.8 
 
 
1027 aa  225  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
1027 aa  224  7e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
1027 aa  224  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.76 
 
 
1055 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.72 
 
 
1087 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 
1398 aa  224  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 
1022 aa  221  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  31.11 
 
 
1358 aa  219  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  30.01 
 
 
914 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.94 
 
 
1014 aa  208  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 
1096 aa  207  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.99 
 
 
1053 aa  204  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  28.79 
 
 
1133 aa  195  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  28.59 
 
 
1311 aa  192  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.87 
 
 
1295 aa  184  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.33 
 
 
1123 aa  181  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.69 
 
 
1271 aa  180  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  28.59 
 
 
1349 aa  174  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  29.01 
 
 
1353 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
1348 aa  166  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  29.62 
 
 
1359 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  29.62 
 
 
1359 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  29.62 
 
 
1350 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  28.85 
 
 
1213 aa  155  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  29.14 
 
 
1359 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  28.3 
 
 
1359 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  29.14 
 
 
1359 aa  154  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  28.5 
 
 
1342 aa  154  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.75 
 
 
1023 aa  152  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
1349 aa  151  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  28.34 
 
 
1349 aa  151  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.54 
 
 
1441 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 
1298 aa  147  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.72 
 
 
956 aa  145  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.11 
 
 
1226 aa  137  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 
1204 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  24.72 
 
 
1169 aa  131  8.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  27.34 
 
 
1264 aa  126  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  26.59 
 
 
1130 aa  124  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
973 aa  121  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.76 
 
 
1153 aa  121  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 
1285 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.57 
 
 
1006 aa  119  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  24.69 
 
 
1114 aa  116  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
1346 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 
1383 aa  111  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  24.24 
 
 
967 aa  110  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.12 
 
 
954 aa  110  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
1340 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.58 
 
 
1029 aa  108  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  34.76 
 
 
665 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  24.57 
 
 
1320 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.82 
 
 
959 aa  105  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  26.42 
 
 
982 aa  105  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
320 aa  104  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  32.9 
 
 
320 aa  104  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.99 
 
 
1126 aa  104  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
1422 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 
1400 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  25 
 
 
1054 aa  100  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27 
 
 
1034 aa  98.2  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  29.8 
 
 
701 aa  96.3  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>