More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4480 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 1037 aa  2104    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  34.03 
 
 		 1105 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  33.23 
 
 		 1122 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  30.52 
 
 		 1048 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  29.56 
 
 		 1148 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.78 
 
 		 1151 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 		 1151 aa  361  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  31.2 
 
 		 1043 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.73 
 
 		 1149 aa  353  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.31 
 
 		 1141 aa  349  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.75 
 
 		 1065 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.81 
 
 		 1377 aa  335  3e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  29.06 
 
 		 1046 aa  333  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 		 1139 aa  333  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  32.6 
 
 		 1227 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 		 1138 aa  326  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.07 
 
 		 1175 aa  319  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.93 
 
 		 1055 aa  318  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 		 1403 aa  313  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.8 
 
 		 1358 aa  305  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 1398 aa  274  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.17 
 
 		 1117 aa  257  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.99 
 
 		 1087 aa  254  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  31.42 
 
 		 1027 aa  254  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 1027 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 1027 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.86 
 
 		 1133 aa  241  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.22 
 
 		 1050 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.22 
 
 		 1050 aa  241  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.21 
 
 		 1023 aa  237  8e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.66 
 
 		 1055 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.75 
 
 		 1053 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.9 
 
 		 1160 aa  233  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.65 
 
 		 1089 aa  225  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.01 
 
 		 1134 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.71 
 
 		 1093 aa  223  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 1402 aa  222  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.67 
 
 		 1080 aa  221  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.24 
 
 		 1081 aa  221  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  31.72 
 
 		 1063 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.35 
 
 		 1291 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.59 
 
 		 1014 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 		 1311 aa  207  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.06 
 
 		 1403 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.55 
 
 		 1360 aa  202  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.7 
 
 		 1123 aa  202  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  27.1 
 
 		 1349 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 1349 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  26.91 
 
 		 1342 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  27.14 
 
 		 1349 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.59 
 
 		 1295 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 		 1198 aa  175  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  24.4 
 
 		 1142 aa  174  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 		 1348 aa  172  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.4 
 
 		 1271 aa  171  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  26.72 
 
 		 1353 aa  171  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.44 
 
 		 1429 aa  170  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  24.4 
 
 		 1094 aa  166  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.26 
 
 		 1096 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.37 
 
 		 1441 aa  151  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.19 
 
 		 914 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  27.57 
 
 		 1126 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  26.56 
 
 		 1204 aa  144  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1298 aa  141  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.58 
 
 		 1289 aa  139  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  26.34 
 
 		 1359 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.96 
 
 		 1226 aa  135  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1213 aa  134  7.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1359 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1359 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1350 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.45 
 
 		 1285 aa  134  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1359 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 		 1359 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.72 
 
 		 1067 aa  129  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 1118 aa  127  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.82 
 
 		 1190 aa  124  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  31.37 
 
 		 479 aa  121  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 956 aa  118  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 320 aa  118  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  34.15 
 
 		 665 aa  118  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  31.62 
 
 		 320 aa  118  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.92 
 
 		 954 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  23.34 
 
 		 1264 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  32 
 
 		 472 aa  115  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 735 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.14 
 
 		 983 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  34.41 
 
 		 463 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.99 
 
 		 805 aa  110  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  34.41 
 
 		 446 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  34.92 
 
 		 859 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  27.48 
 
 		 966 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 		 462 aa  108  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  34.02 
 
 		 524 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.09 
 
 		 900 aa  107  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  32.26 
 
 		 465 aa  107  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  23.32 
 
 		 1169 aa  106  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  23.47 
 
 		 1130 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  34.41 
 
 		 529 aa  106  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 973 aa  106  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>