229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2055 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  100 
 
 
1289 aa  2584    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  27.91 
 
 
1133 aa  170  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 
1148 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 
1151 aa  145  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.7 
 
 
1105 aa  145  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.77 
 
 
1151 aa  144  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  26.48 
 
 
1048 aa  138  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  26.42 
 
 
1043 aa  135  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.54 
 
 
1403 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  25.07 
 
 
1046 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  25.39 
 
 
1122 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.16 
 
 
1055 aa  131  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  25.03 
 
 
1139 aa  128  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.41 
 
 
1141 aa  128  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.58 
 
 
1037 aa  125  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.23 
 
 
1149 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  26.23 
 
 
1377 aa  120  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.09 
 
 
1138 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
1398 aa  110  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  26.23 
 
 
1065 aa  109  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.74 
 
 
1422 aa  105  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  24.81 
 
 
1402 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1429 aa  103  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 
1295 aa  98.2  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.87 
 
 
1080 aa  96.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  25.05 
 
 
1271 aa  96.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.41 
 
 
1175 aa  95.5  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.14 
 
 
1227 aa  95.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.72 
 
 
1117 aa  95.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  27.15 
 
 
1123 aa  94.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  26 
 
 
1349 aa  93.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.74 
 
 
1134 aa  92.8  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 
1311 aa  91.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.17 
 
 
1067 aa  89.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  25.81 
 
 
1348 aa  89.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  26.9 
 
 
1422 aa  85.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  30.09 
 
 
966 aa  85.5  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.17 
 
 
1441 aa  82.8  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.51 
 
 
1183 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  26.43 
 
 
1160 aa  82  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.79 
 
 
1029 aa  82.4  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  24.23 
 
 
1118 aa  82  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  26.1 
 
 
1198 aa  81.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.46 
 
 
1055 aa  81.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.69 
 
 
1081 aa  80.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.92 
 
 
1403 aa  80.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  27.84 
 
 
914 aa  79  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  25.39 
 
 
956 aa  79  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 
1349 aa  78.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 
1349 aa  78.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  24.37 
 
 
1922 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.3 
 
 
1015 aa  77  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  27.2 
 
 
1353 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 
1908 aa  76.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 
1342 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.39 
 
 
1093 aa  75.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26 
 
 
1169 aa  75.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  28.18 
 
 
956 aa  75.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
973 aa  73.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.59 
 
 
1142 aa  73.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.59 
 
 
1264 aa  73.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.93 
 
 
1094 aa  73.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2258  SARP family transcriptional regulator  31.72 
 
 
647 aa  72.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0203775  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.38 
 
 
1468 aa  72.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
1235 aa  72.4  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.46 
 
 
1089 aa  72  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 
1321 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 
1298 aa  71.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
1383 aa  71.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  29.61 
 
 
1050 aa  70.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  25.21 
 
 
1123 aa  70.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.14 
 
 
494 aa  70.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  24.75 
 
 
1027 aa  70.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  24.88 
 
 
1027 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  24.88 
 
 
1027 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.59 
 
 
1014 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  27.01 
 
 
983 aa  69.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
975 aa  68.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.22 
 
 
1360 aa  68.6  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  19.73 
 
 
1153 aa  67.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.61 
 
 
916 aa  67.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  28.96 
 
 
786 aa  67  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  27.1 
 
 
909 aa  67  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.72 
 
 
1075 aa  65.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  25.58 
 
 
932 aa  66.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  19.73 
 
 
1805 aa  65.9  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  32.52 
 
 
1131 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  25.7 
 
 
954 aa  65.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 
1213 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 
1359 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 
1350 aa  65.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 
1359 aa  65.1  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  25.32 
 
 
1022 aa  65.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 
1359 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  24.62 
 
 
1020 aa  65.1  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  25.93 
 
 
1359 aa  65.1  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.49 
 
 
1023 aa  65.1  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1206  hypothetical protein  25.42 
 
 
1142 aa  65.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 
1359 aa  65.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  24.5 
 
 
723 aa  65.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>