More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3419 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
909 aa  1746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 
928 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  47.12 
 
 
884 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  42.03 
 
 
919 aa  488  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  43.46 
 
 
884 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  41.49 
 
 
946 aa  468  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 
920 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 
911 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  35.57 
 
 
930 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  35.99 
 
 
928 aa  359  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.77 
 
 
917 aa  357  6.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.98 
 
 
913 aa  354  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 
927 aa  350  7e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.81 
 
 
923 aa  349  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 
938 aa  349  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
937 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  36.44 
 
 
937 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  36.23 
 
 
937 aa  344  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.95 
 
 
913 aa  343  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  36.84 
 
 
929 aa  333  8e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.13 
 
 
940 aa  329  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 
918 aa  323  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.96 
 
 
879 aa  317  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 
910 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  36.51 
 
 
961 aa  311  4e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  37.27 
 
 
936 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 
905 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  37.95 
 
 
892 aa  302  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  35.52 
 
 
919 aa  295  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.69 
 
 
995 aa  295  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  36.26 
 
 
913 aa  293  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  33.41 
 
 
923 aa  279  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  43.16 
 
 
928 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  45.78 
 
 
940 aa  250  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 
925 aa  244  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  43.16 
 
 
903 aa  224  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.58 
 
 
922 aa  207  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 
916 aa  203  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  39.32 
 
 
955 aa  201  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 
915 aa  200  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  40.74 
 
 
934 aa  200  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 
953 aa  194  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.7 
 
 
927 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  41.11 
 
 
1064 aa  164  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
919 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  28.84 
 
 
919 aa  160  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.65 
 
 
919 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  34.54 
 
 
835 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  45.45 
 
 
240 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.98 
 
 
959 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  37.53 
 
 
889 aa  146  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  43.2 
 
 
923 aa  127  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.36 
 
 
998 aa  124  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  48.41 
 
 
929 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 
904 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  28.63 
 
 
927 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  29.04 
 
 
916 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
1000 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  41.75 
 
 
950 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  39.52 
 
 
929 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  37.44 
 
 
921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
921 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  36.95 
 
 
921 aa  95.1  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 
923 aa  94.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 
894 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.47 
 
 
977 aa  92  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 
998 aa  89  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  33 
 
 
921 aa  87.4  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.09 
 
 
1050 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.09 
 
 
1050 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.47 
 
 
947 aa  81.3  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 
894 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  30.55 
 
 
997 aa  80.5  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  39.83 
 
 
893 aa  79  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
881 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
881 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
876 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  42.55 
 
 
910 aa  77.4  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.91 
 
 
954 aa  76.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  40.34 
 
 
189 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 
1227 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 
897 aa  75.9  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  28.59 
 
 
918 aa  75.5  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.97 
 
 
1055 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  26.84 
 
 
1015 aa  72.4  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
1037 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  30.84 
 
 
953 aa  72.8  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  38.99 
 
 
982 aa  72.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.36 
 
 
1053 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
236 aa  72  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  27.25 
 
 
959 aa  71.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.92 
 
 
1105 aa  71.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  37.95 
 
 
919 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
973 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.32 
 
 
900 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.59 
 
 
1013 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  54.43 
 
 
959 aa  68.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  29.96 
 
 
914 aa  68.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 
946 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
1030 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>