More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3616 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 925 aa  678    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 923 aa  1785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  44.06 
 
 		 940 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 937 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  41.33 
 
 		 937 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  41.69 
 
 		 930 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  41.57 
 
 		 937 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  38.97 
 
 		 905 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  41.25 
 
 		 929 aa  433  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  40.22 
 
 		 928 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  38.82 
 
 		 903 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 950 aa  405  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  39.03 
 
 		 918 aa  395  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  39.57 
 
 		 936 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.45 
 
 		 919 aa  388  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 919 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  36.94 
 
 		 884 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 894 aa  357  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.31 
 
 		 909 aa  353  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  36.74 
 
 		 927 aa  346  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.99 
 
 		 913 aa  306  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  34.33 
 
 		 928 aa  303  9e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 911 aa  300  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  35.67 
 
 		 946 aa  296  8e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  36.09 
 
 		 920 aa  294  6e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 940 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 904 aa  270  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 938 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  34.22 
 
 		 884 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 879 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  44.63 
 
 		 913 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 928 aa  221  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  38.75 
 
 		 922 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.92 
 
 		 923 aa  210  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 995 aa  201  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 919 aa  200  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.65 
 
 		 919 aa  200  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.55 
 
 		 919 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  36.86 
 
 		 892 aa  184  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.22 
 
 		 927 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  36.39 
 
 		 923 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  37.15 
 
 		 955 aa  179  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  34.73 
 
 		 915 aa  174  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.79 
 
 		 921 aa  165  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  32.88 
 
 		 917 aa  164  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.24 
 
 		 953 aa  162  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.94 
 
 		 934 aa  155  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.8 
 
 		 1064 aa  150  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  43.58 
 
 		 240 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.7 
 
 		 961 aa  141  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 889 aa  141  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  44.33 
 
 		 923 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 916 aa  122  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 910 aa  121  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  33.87 
 
 		 919 aa  114  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  35.21 
 
 		 916 aa  107  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  33.45 
 
 		 977 aa  104  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 998 aa  102  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 959 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 		 953 aa  97.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.27 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.27 
 
 		 921 aa  95.5  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 		 951 aa  93.6  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  33.21 
 
 		 929 aa  92  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  35.98 
 
 		 897 aa  91.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.14 
 
 		 946 aa  90.9  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 913 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 881 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 881 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 876 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 189 aa  89  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  37.3 
 
 		 835 aa  87.8  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 894 aa  87  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 929 aa  87  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.52 
 
 		 927 aa  86.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  43.06 
 
 		 947 aa  85.1  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.48 
 
 		 893 aa  84.7  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 997 aa  84.7  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  40.12 
 
 		 932 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.69 
 
 		 947 aa  81.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 948 aa  81.3  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 877 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 910 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  31.08 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 974 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 943 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 		 967 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  31.75 
 
 		 900 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  28.69 
 
 		 1190 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  44.53 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 1000 aa  74.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 907 aa  71.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 954 aa  70.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.16 
 
 		 973 aa  70.1  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.99 
 
 		 1067 aa  70.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  28.72 
 
 		 1075 aa  68.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.75 
 
 		 900 aa  68.2  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 940 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1485  transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 952 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>