More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5653 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 921 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  48.19 
 
 		 921 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  48.64 
 
 		 919 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 921 aa  1786    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  48.41 
 
 		 921 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  66.52 
 
 		 900 aa  1006    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  49.89 
 
 		 929 aa  705    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 919 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  43.61 
 
 		 919 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  43.5 
 
 		 919 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  45.09 
 
 		 977 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  29.71 
 
 		 925 aa  187  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  39.15 
 
 		 916 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  31.79 
 
 		 923 aa  185  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  28.02 
 
 		 884 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.61 
 
 		 998 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  27.56 
 
 		 917 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.68 
 
 		 922 aa  141  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  34.91 
 
 		 997 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  28.73 
 
 		 923 aa  137  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  29.46 
 
 		 905 aa  134  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  31.86 
 
 		 929 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 918 aa  132  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  29 
 
 		 893 aa  132  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.28 
 
 		 919 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  31.28 
 
 		 915 aa  125  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  31 
 
 		 916 aa  123  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 903 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  29.53 
 
 		 995 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.84 
 
 		 879 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  29.13 
 
 		 923 aa  111  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  28.72 
 
 		 936 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 910 aa  110  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  33.66 
 
 		 930 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.08 
 
 		 1006 aa  106  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  32.54 
 
 		 884 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 		 953 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  43.07 
 
 		 913 aa  102  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  34.79 
 
 		 940 aa  102  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 894 aa  101  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 876 aa  100  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  26.71 
 
 		 920 aa  100  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.09 
 
 		 928 aa  99.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  36.13 
 
 		 913 aa  97.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 897 aa  97.1  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  32.07 
 
 		 946 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 881 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 881 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  34.78 
 
 		 913 aa  94.7  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  43.09 
 
 		 927 aa  92.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.16 
 
 		 923 aa  92.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.75 
 
 		 910 aa  91.3  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  44.94 
 
 		 938 aa  90.5  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  32.25 
 
 		 955 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 911 aa  89.7  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  33.22 
 
 		 909 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  31.9 
 
 		 892 aa  89.4  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  39.6 
 
 		 189 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  30.87 
 
 		 928 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 889 aa  88.2  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  38.51 
 
 		 940 aa  87.8  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 937 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  36.08 
 
 		 937 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  36.08 
 
 		 937 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  32.98 
 
 		 541 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  37.97 
 
 		 998 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  37.37 
 
 		 959 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0135  transcriptional regulator, LuxR family  36.41 
 
 		 1052 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.8 
 
 		 1264 aa  82.8  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  30.27 
 
 		 919 aa  81.6  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  27.35 
 
 		 713 aa  81.6  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 950 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  32.51 
 
 		 855 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  24.95 
 
 		 973 aa  77  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.34 
 
 		 1175 aa  77.4  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  28.99 
 
 		 956 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  28.34 
 
 		 918 aa  76.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  29.83 
 
 		 983 aa  75.5  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  34.29 
 
 		 928 aa  75.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 993 aa  75.1  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0437  LuxR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139362  normal  0.0303285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  26.55 
 
 		 1147 aa  73.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0414  LuxR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 544 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.865726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.12 
 
 		 927 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 948 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  29.36 
 
 		 927 aa  73.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  27.06 
 
 		 960 aa  72.8  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.7 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  32.66 
 
 		 934 aa  71.2  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  28.26 
 
 		 956 aa  70.5  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  30.86 
 
 		 940 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 1000 aa  69.3  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 974 aa  69.7  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 951 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.07 
 
 		 1067 aa  68.9  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 1148 aa  68.6  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  26.46 
 
 		 937 aa  68.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 1084 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>