More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2042 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  100 
 
 
947 aa  1805    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  33.4 
 
 
974 aa  262  2e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  35.69 
 
 
943 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 
960 aa  194  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.39 
 
 
998 aa  178  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  29.61 
 
 
919 aa  153  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 
948 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  39.74 
 
 
855 aa  125  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 
946 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  33.6 
 
 
951 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  30.01 
 
 
884 aa  111  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  30.57 
 
 
925 aa  106  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  45.2 
 
 
932 aa  104  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
877 aa  98.6  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 
1104 aa  97.8  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  28.46 
 
 
855 aa  95.5  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  31.52 
 
 
913 aa  95.1  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 
947 aa  94.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 
952 aa  94  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  37.7 
 
 
917 aa  92.8  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 
928 aa  93.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 
1029 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.41 
 
 
927 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  35.26 
 
 
995 aa  88.2  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.59 
 
 
913 aa  87.8  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.77 
 
 
937 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
937 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  32.98 
 
 
884 aa  84.7  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.77 
 
 
937 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  34 
 
 
910 aa  84.7  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  36.32 
 
 
923 aa  81.6  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 
940 aa  81.3  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 
918 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.01 
 
 
903 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 
928 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  38.51 
 
 
892 aa  79  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 
953 aa  78.2  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
1000 aa  78.6  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.53 
 
 
940 aa  77.4  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 
923 aa  77.4  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  30.46 
 
 
955 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  30.71 
 
 
908 aa  75.5  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 
913 aa  75.1  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  38.95 
 
 
923 aa  75.5  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.72 
 
 
998 aa  74.7  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.39 
 
 
879 aa  74.7  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 
925 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.85 
 
 
1015 aa  74.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
921 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
921 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  32.89 
 
 
921 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  28.73 
 
 
953 aa  72.4  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  39.2 
 
 
928 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 
916 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 
904 aa  72  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.95 
 
 
929 aa  71.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  54.84 
 
 
901 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  34.59 
 
 
894 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
919 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.85 
 
 
919 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 
956 aa  69.7  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  38.62 
 
 
938 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  40.12 
 
 
919 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.85 
 
 
919 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  34.54 
 
 
961 aa  69.3  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
881 aa  68.9  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  30.89 
 
 
943 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
994 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  36.36 
 
 
929 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  35.03 
 
 
936 aa  68.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  27.65 
 
 
1055 aa  68.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.92 
 
 
1013 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 
983 aa  67  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.4 
 
 
713 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  27.41 
 
 
1712 aa  67  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  37.33 
 
 
930 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  26.86 
 
 
919 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  39.1 
 
 
889 aa  66.6  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 
1074 aa  66.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.26 
 
 
258 aa  65.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
1298 aa  65.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
881 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
881 aa  65.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 
214 aa  65.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.93 
 
 
1190 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
876 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.36 
 
 
232 aa  65.1  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 
956 aa  64.7  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  54.55 
 
 
212 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
895 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  26.89 
 
 
1837 aa  64.3  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  54.55 
 
 
229 aa  64.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
212 aa  63.9  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 
907 aa  63.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  29.91 
 
 
916 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 
218 aa  63.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
215 aa  63.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 
226 aa  63.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  33.76 
 
 
934 aa  63.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  27.08 
 
 
1193 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>