More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1890 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 929 aa  1776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  36.4 
 
 		 927 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.06 
 
 		 919 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 		 928 aa  351  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  38.39 
 
 		 884 aa  345  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  37.22 
 
 		 934 aa  333  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 889 aa  312  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  34.72 
 
 		 922 aa  311  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  35.84 
 
 		 923 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  37.03 
 
 		 892 aa  301  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  35.97 
 
 		 920 aa  299  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 925 aa  263  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  36.07 
 
 		 884 aa  255  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 938 aa  255  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  35.01 
 
 		 879 aa  243  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  41.21 
 
 		 928 aa  235  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 950 aa  227  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 1064 aa  227  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  44.12 
 
 		 918 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  44.41 
 
 		 930 aa  222  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  42.12 
 
 		 929 aa  204  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  40.6 
 
 		 955 aa  203  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  41.03 
 
 		 928 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  43.8 
 
 		 904 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  31.17 
 
 		 995 aa  198  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 953 aa  194  9e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.21 
 
 		 946 aa  187  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.85 
 
 		 923 aa  185  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  41.82 
 
 		 937 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 919 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 894 aa  177  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  39.53 
 
 		 940 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  37.86 
 
 		 927 aa  164  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 919 aa  159  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  29.41 
 
 		 919 aa  159  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  31.46 
 
 		 915 aa  158  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  41.9 
 
 		 905 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.98 
 
 		 919 aa  155  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  41.01 
 
 		 936 aa  154  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  44.54 
 
 		 961 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  45.19 
 
 		 923 aa  148  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.26 
 
 		 959 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  28.93 
 
 		 929 aa  144  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.74 
 
 		 910 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  32.28 
 
 		 916 aa  140  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  43.84 
 
 		 240 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 1000 aa  118  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  33.71 
 
 		 900 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.25 
 
 		 919 aa  112  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 909 aa  112  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  40.68 
 
 		 913 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 921 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 937 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.41 
 
 		 921 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  44.08 
 
 		 937 aa  108  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  34.46 
 
 		 997 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.12 
 
 		 921 aa  107  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.84 
 
 		 913 aa  101  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  36.24 
 
 		 940 aa  99.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.24 
 
 		 927 aa  99  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  35.77 
 
 		 923 aa  98.6  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  40.37 
 
 		 917 aa  97.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  41.72 
 
 		 911 aa  94  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  35.86 
 
 		 903 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.54 
 
 		 913 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  28.6 
 
 		 897 aa  87  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  31.88 
 
 		 960 aa  86.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 946 aa  85.9  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 998 aa  85.5  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 1190 aa  84.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 967 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1193 aa  82.8  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 973 aa  80.9  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  26.69 
 
 		 953 aa  80.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  34.62 
 
 		 977 aa  78.6  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 951 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.88 
 
 		 1014 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  30.46 
 
 		 893 aa  75.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5213  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 		 867 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 881 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 881 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 876 aa  75.5  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 189 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.59 
 
 		 947 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  29.22 
 
 		 974 aa  71.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 894 aa  70.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.28 
 
 		 992 aa  69.3  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 956 aa  69.7  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8281  hypothetical protein  27.32 
 
 		 701 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0961782  normal  0.672711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  26.89 
 
 		 1005 aa  68.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 910 aa  68.2  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  39.78 
 
 		 948 aa  67.8  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 236 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.51 
 
 		 1067 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  43.43 
 
 		 957 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  41 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  28.73 
 
 		 1006 aa  65.1  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  43.16 
 
 		 963 aa  65.1  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.97 
 
 		 1087 aa  64.7  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>