129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5141 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  100 
 
 		 240 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  58.47 
 
 		 918 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  54.58 
 
 		 919 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  53.18 
 
 		 928 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  51.13 
 
 		 937 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  51.13 
 
 		 937 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  51.36 
 
 		 940 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  51.13 
 
 		 937 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  51.78 
 
 		 930 aa  182  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  48.5 
 
 		 929 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 903 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  50.23 
 
 		 884 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  50.45 
 
 		 936 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 909 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 		 894 aa  155  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  42.13 
 
 		 928 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 950 aa  148  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  48.4 
 
 		 884 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 927 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 905 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 925 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 920 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.6 
 
 		 946 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 		 911 aa  138  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 923 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.89 
 
 		 892 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  42.45 
 
 		 934 aa  135  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  44.14 
 
 		 953 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 928 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.65 
 
 		 938 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  40.49 
 
 		 922 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 923 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  41.67 
 
 		 919 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  43.58 
 
 		 904 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  39.29 
 
 		 913 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.86 
 
 		 955 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  35.94 
 
 		 917 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  42.36 
 
 		 929 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  33.78 
 
 		 913 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 940 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  39.34 
 
 		 961 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 913 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.91 
 
 		 927 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  36.82 
 
 		 923 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  42.22 
 
 		 915 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 889 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.67 
 
 		 910 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 879 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 		 1064 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 995 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  34.72 
 
 		 916 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  34.44 
 
 		 923 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 1000 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 919 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  37.21 
 
 		 919 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  37.21 
 
 		 919 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.9 
 
 		 947 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 1141 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 953 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 1015 aa  58.5  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 1141 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 1141 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  35.14 
 
 		 900 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  28.65 
 
 		 927 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.24 
 
 		 956 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1349 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1349 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  44.97 
 
 		 916 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  29.8 
 
 		 940 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  31.33 
 
 		 959 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 960 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  36.36 
 
 		 929 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 932 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 1348 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 1342 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 		 952 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.73 
 
 		 1150 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 877 aa  52.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 		 1046 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 1030 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 1349 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.33 
 
 		 919 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 951 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  32.31 
 
 		 1071 aa  50.4  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  31.1 
 
 		 1169 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  29.67 
 
 		 992 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  24.9 
 
 		 959 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 1297 aa  49.3  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 921 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  30.83 
 
 		 921 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 		 981 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  30.08 
 
 		 921 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.35 
 
 		 900 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.03 
 
 		 1885 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  33.15 
 
 		 1744 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  33.82 
 
 		 921 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 		 1311 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  26.76 
 
 		 907 aa  47  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  24.61 
 
 		 1055 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  24.33 
 
 		 1712 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>