More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0780 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 
919 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
921 aa  1809    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  44.88 
 
 
919 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  100 
 
 
921 aa  1809    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  48.06 
 
 
919 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  48.19 
 
 
921 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  44.55 
 
 
919 aa  667    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  99.57 
 
 
921 aa  1803    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  49.56 
 
 
900 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  47.81 
 
 
929 aa  677    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  42.17 
 
 
977 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  27.87 
 
 
925 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  29.74 
 
 
923 aa  166  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
889 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 
916 aa  146  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  28.21 
 
 
917 aa  144  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  29.54 
 
 
918 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  32.63 
 
 
922 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  26.93 
 
 
920 aa  129  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.73 
 
 
998 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  29.17 
 
 
961 aa  127  8.000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  29.59 
 
 
995 aa  126  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  32.2 
 
 
928 aa  124  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 
997 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
913 aa  120  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  26.37 
 
 
923 aa  117  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  34.7 
 
 
884 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  35.83 
 
 
919 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 
915 aa  115  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  31.21 
 
 
923 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 
959 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.7 
 
 
927 aa  112  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  31.67 
 
 
930 aa  110  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  26.91 
 
 
893 aa  107  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 
910 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  32.27 
 
 
934 aa  105  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  29.81 
 
 
913 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  37.34 
 
 
884 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  30.92 
 
 
928 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 
953 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  30.83 
 
 
955 aa  101  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.17 
 
 
879 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  30.5 
 
 
940 aa  99.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 
927 aa  99.4  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  29.27 
 
 
918 aa  97.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  31.32 
 
 
928 aa  95.5  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  31.94 
 
 
913 aa  95.5  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 
929 aa  94.7  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  42.4 
 
 
916 aa  90.5  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 
910 aa  90.5  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  29.36 
 
 
1067 aa  89.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  38.35 
 
 
909 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
881 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
881 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.46 
 
 
940 aa  88.2  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 
998 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
937 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 
894 aa  87  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  32.73 
 
 
937 aa  87.4  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
876 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  32.73 
 
 
937 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 
960 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  26.02 
 
 
963 aa  84.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  31.57 
 
 
919 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  26.73 
 
 
911 aa  83.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  25.89 
 
 
957 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.25 
 
 
1146 aa  82.4  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 
948 aa  82.8  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 
974 aa  82.4  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  47.93 
 
 
938 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 
946 aa  82  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
1000 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  34.9 
 
 
897 aa  81.3  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  31.25 
 
 
923 aa  81.3  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  33.92 
 
 
189 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  32.18 
 
 
892 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  26.94 
 
 
900 aa  79.7  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  30.83 
 
 
927 aa  79.7  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 
992 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
541 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 
946 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  40.72 
 
 
951 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  43.44 
 
 
932 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.1 
 
 
1118 aa  78.2  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 
973 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 
1015 aa  77  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
877 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  29.41 
 
 
982 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.85 
 
 
966 aa  76.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  30.77 
 
 
929 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.9 
 
 
1190 aa  76.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  41.1 
 
 
936 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.67 
 
 
903 aa  76.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  26.86 
 
 
907 aa  75.5  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  25.5 
 
 
1216 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
950 aa  75.1  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  29.95 
 
 
963 aa  75.1  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  30.05 
 
 
1064 aa  74.7  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  25.7 
 
 
1029 aa  74.3  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0427  LuxR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
544 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>