More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2286 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  100 
 
 		 961 aa  1811    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  63.07 
 
 		 934 aa  927    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  60 
 
 		 955 aa  927    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  44.43 
 
 		 923 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  42.74 
 
 		 922 aa  525  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  37.21 
 
 		 927 aa  360  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  37.2 
 
 		 928 aa  347  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  36.15 
 
 		 928 aa  333  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  36.76 
 
 		 884 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  33.79 
 
 		 919 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  32.38 
 
 		 930 aa  279  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 925 aa  259  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  32.43 
 
 		 929 aa  251  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  31.22 
 
 		 917 aa  221  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  34.5 
 
 		 938 aa  219  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  32.69 
 
 		 936 aa  208  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  39.79 
 
 		 892 aa  200  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 879 aa  187  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  37.72 
 
 		 928 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 		 918 aa  178  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  38.35 
 
 		 940 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  37.95 
 
 		 919 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 889 aa  171  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 953 aa  167  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 920 aa  166  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  39.86 
 
 		 913 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.87 
 
 		 913 aa  164  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.12 
 
 		 923 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  41.3 
 
 		 904 aa  161  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 923 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 950 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  37.47 
 
 		 927 aa  156  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  36.01 
 
 		 911 aa  147  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  35.32 
 
 		 884 aa  143  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  48.11 
 
 		 909 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  29.76 
 
 		 921 aa  142  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 921 aa  141  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.55 
 
 		 921 aa  141  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  38.27 
 
 		 910 aa  140  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 940 aa  140  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  35.06 
 
 		 894 aa  138  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 919 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.88 
 
 		 919 aa  137  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  39.46 
 
 		 905 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  27.55 
 
 		 919 aa  131  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 929 aa  130  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  36.57 
 
 		 903 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 916 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.46 
 
 		 923 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  39.34 
 
 		 240 aa  117  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 1064 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 995 aa  115  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  42.67 
 
 		 946 aa  112  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  32.35 
 
 		 919 aa  108  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  30.13 
 
 		 927 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  40.61 
 
 		 916 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 937 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  35.07 
 
 		 937 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  35.07 
 
 		 937 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  32.98 
 
 		 929 aa  101  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  40.67 
 
 		 913 aa  101  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  25.12 
 
 		 998 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  28.67 
 
 		 910 aa  92.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  32.85 
 
 		 997 aa  90.9  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 1000 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.78 
 
 		 921 aa  86.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  30.18 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  31.18 
 
 		 954 aa  83.2  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  30.17 
 
 		 1006 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 835 aa  80.5  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  28.33 
 
 		 959 aa  79.7  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  28.12 
 
 		 1094 aa  79  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 897 aa  77  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 894 aa  76.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.04 
 
 		 1081 aa  75.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 967 aa  75.1  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  33.47 
 
 		 998 aa  75.1  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.02 
 
 		 1080 aa  73.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.98 
 
 		 1105 aa  73.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  32.64 
 
 		 947 aa  72.8  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 992 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 1015 aa  72.4  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  32.17 
 
 		 951 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.19 
 
 		 1013 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 973 aa  72  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.34 
 
 		 1037 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 877 aa  70.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  31.49 
 
 		 947 aa  69.7  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.38 
 
 		 1141 aa  69.3  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  39.68 
 
 		 977 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 		 974 aa  68.6  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.81 
 
 		 1117 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 		 1142 aa  67.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 953 aa  67.4  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  27.04 
 
 		 1005 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 1022 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 881 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.08 
 
 		 1075 aa  65.9  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.24 
 
 		 213 aa  65.9  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8304  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 1084 aa  65.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>