More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4923 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 937 aa  1840    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  100 
 
 		 937 aa  1840    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  62.62 
 
 		 930 aa  1010    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  63.74 
 
 		 940 aa  990    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  99.57 
 
 		 937 aa  1834    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  46.46 
 
 		 929 aa  618  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  46.58 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 918 aa  602  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  46.59 
 
 		 903 aa  576  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  46.1 
 
 		 919 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 905 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  43.28 
 
 		 936 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 950 aa  505  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 923 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  39.89 
 
 		 925 aa  481  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  41.81 
 
 		 894 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  37.42 
 
 		 919 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 909 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  36.85 
 
 		 913 aa  287  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  47.68 
 
 		 884 aa  277  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 928 aa  274  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 946 aa  268  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  30.67 
 
 		 917 aa  265  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.3 
 
 		 879 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  40.89 
 
 		 911 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 927 aa  241  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  31.2 
 
 		 923 aa  241  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 928 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  39.36 
 
 		 927 aa  219  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  41.92 
 
 		 920 aa  216  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  31.76 
 
 		 923 aa  215  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  44.81 
 
 		 884 aa  211  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  43.65 
 
 		 892 aa  207  8e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 913 aa  202  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5141  Sigma 54 interacting domain protein  51.13 
 
 		 240 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  37.36 
 
 		 923 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  35.4 
 
 		 922 aa  190  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  37.83 
 
 		 953 aa  188  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  37.59 
 
 		 940 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  36.24 
 
 		 934 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  39.95 
 
 		 889 aa  172  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  29.94 
 
 		 959 aa  169  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 910 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.71 
 
 		 995 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3533  transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 1064 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0388  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 916 aa  122  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0286476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  35.19 
 
 		 938 aa  121  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  43.68 
 
 		 904 aa  114  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  31.48 
 
 		 919 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 919 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  31.48 
 
 		 919 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  35.07 
 
 		 961 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2467  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 915 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000112421  hitchhiker  0.00668806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  38.84 
 
 		 955 aa  108  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 998 aa  106  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  33.17 
 
 		 919 aa  102  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  44.08 
 
 		 929 aa  101  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 1000 aa  96.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  30.53 
 
 		 929 aa  96.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  33.33 
 
 		 893 aa  95.1  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3894  transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 897 aa  94.7  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  25.83 
 
 		 910 aa  94.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.33 
 
 		 894 aa  92.8  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1970  transcriptional regulator, LuxR family  33.24 
 
 		 835 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000157383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 881 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 881 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 876 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  43.61 
 
 		 946 aa  89  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  38.02 
 
 		 913 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  36.77 
 
 		 189 aa  85.9  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.42 
 
 		 951 aa  85.1  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  31.18 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  31.45 
 
 		 921 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.97 
 
 		 953 aa  84  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  37.65 
 
 		 974 aa  84  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  39.73 
 
 		 927 aa  82.8  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  36.22 
 
 		 932 aa  81.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 877 aa  80.9  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4020  LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 236 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  29.76 
 
 		 977 aa  80.9  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  35.44 
 
 		 948 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 940 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  36.08 
 
 		 921 aa  74.7  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 952 aa  73.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 947 aa  73.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1156  regulatory protein, LuxR  32.97 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0131958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1851  transcriptional regulator, LuxR family  32.57 
 
 		 907 aa  72  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640088  normal  0.606173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.19 
 
 		 981 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 998 aa  68.6  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.02 
 
 		 1227 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.89 
 
 		 1117 aa  66.6  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  36.36 
 
 		 947 aa  67  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.15 
 
 		 1123 aa  67  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  35.09 
 
 		 956 aa  66.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1892  transcriptional regulator, LuxR family  29.51 
 
 		 997 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  36.42 
 
 		 943 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.71 
 
 		 1075 aa  64.3  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  56.14 
 
 		 876 aa  64.3  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  29.3 
 
 		 918 aa  63.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>