More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1126 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
951 aa  1749    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  42.87 
 
 
946 aa  407  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  43.41 
 
 
952 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 
998 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  39.31 
 
 
948 aa  362  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 
974 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 
947 aa  357  6.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.1 
 
 
932 aa  345  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  38.64 
 
 
940 aa  335  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  40.46 
 
 
960 aa  296  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 
943 aa  282  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  34.75 
 
 
947 aa  257  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  30.71 
 
 
925 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  45.33 
 
 
855 aa  179  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.84 
 
 
908 aa  167  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 
1104 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
877 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
994 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
919 aa  115  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  26.64 
 
 
919 aa  115  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  26.54 
 
 
919 aa  114  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 
998 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  30.72 
 
 
855 aa  100  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  31.1 
 
 
927 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.16 
 
 
1151 aa  97.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2716  transcriptional regulator, LuxR family  39.08 
 
 
941 aa  95.9  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000419619  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  31.53 
 
 
1118 aa  95.5  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4086  transcriptional regulator, LuxR family  32.75 
 
 
959 aa  94.7  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.105743  hitchhiker  0.000559176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  30.37 
 
 
943 aa  94  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  30.26 
 
 
723 aa  91.3  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 
939 aa  90.9  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 
905 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
1403 aa  87.4  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  34.8 
 
 
1074 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  37.08 
 
 
937 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  37.08 
 
 
937 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  37.08 
 
 
937 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.54 
 
 
925 aa  86.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 
995 aa  85.9  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  29.8 
 
 
928 aa  85.1  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.42 
 
 
1146 aa  84.7  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.43 
 
 
1141 aa  84.7  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.4 
 
 
1029 aa  84.3  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
1000 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.18 
 
 
923 aa  84  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.75 
 
 
1015 aa  84  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  40.79 
 
 
919 aa  84.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.2 
 
 
1141 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.2 
 
 
1141 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  30.25 
 
 
922 aa  82  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  39.41 
 
 
923 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  32.73 
 
 
1139 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  34.24 
 
 
929 aa  79.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 
928 aa  79  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
931 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
879 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  32.29 
 
 
956 aa  78.6  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 
1022 aa  78.2  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.16 
 
 
1055 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.65 
 
 
894 aa  76.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  28.5 
 
 
1193 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  38.67 
 
 
189 aa  76.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  37.91 
 
 
923 aa  75.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.46 
 
 
1150 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
881 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  29.92 
 
 
919 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
881 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.07 
 
 
876 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  37.58 
 
 
894 aa  75.5  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.12 
 
 
713 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 
953 aa  75.5  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  34.27 
 
 
940 aa  75.1  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  37.98 
 
 
921 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.37 
 
 
1122 aa  75.1  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  27.73 
 
 
1744 aa  74.7  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 
921 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 
927 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  37.98 
 
 
921 aa  74.3  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
1298 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  26.91 
 
 
919 aa  74.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  28.35 
 
 
1123 aa  73.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  40.5 
 
 
977 aa  73.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  32.22 
 
 
909 aa  73.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 
929 aa  73.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  33.92 
 
 
918 aa  73.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  27.91 
 
 
900 aa  72.8  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  30.89 
 
 
1054 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.93 
 
 
1014 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  33.02 
 
 
961 aa  72.8  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  35.02 
 
 
913 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5449  regulatory protein, LuxR  37.5 
 
 
929 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651418  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.46 
 
 
1198 aa  72  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5019  transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 
916 aa  71.6  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.385321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  28.61 
 
 
1029 aa  70.9  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  34.23 
 
 
893 aa  70.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  29.56 
 
 
1013 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  40.31 
 
 
938 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  35.29 
 
 
913 aa  70.1  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  28.96 
 
 
872 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
1346 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>