169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2421 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2421  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 939 aa  1795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.924633  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  39.16 
 
 		 952 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.72 
 
 		 998 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 		 947 aa  99.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 1104 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  34.18 
 
 		 974 aa  88.6  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.44 
 
 		 951 aa  84.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 877 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 932 aa  77.8  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 998 aa  70.5  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  32.93 
 
 		 946 aa  68.2  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  33.85 
 
 		 940 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 927 aa  62  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  33.74 
 
 		 948 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  34.32 
 
 		 920 aa  60.1  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  30.14 
 
 		 923 aa  60.1  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  28.29 
 
 		 1114 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1486  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  28.29 
 
 		 925 aa  57.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 938 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  26.34 
 
 		 955 aa  56.2  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  32.28 
 
 		 1051 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  31.97 
 
 		 910 aa  55.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  35 
 
 		 1054 aa  54.7  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  35.33 
 
 		 905 aa  54.7  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  26.69 
 
 		 943 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 994 aa  54.3  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  35.47 
 
 		 884 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.16 
 
 		 947 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  30.52 
 
 		 189 aa  53.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  45.76 
 
 		 929 aa  53.5  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  23.81 
 
 		 1123 aa  52.8  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  28.38 
 
 		 905 aa  52.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 879 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  29.17 
 
 		 894 aa  52.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 876 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  32.16 
 
 		 995 aa  52  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 881 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 881 aa  52  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 925 aa  51.6  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  32.8 
 
 		 903 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 		 919 aa  51.2  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3576  two component LuxR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 228 aa  51.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.45 
 
 		 900 aa  51.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  36.64 
 
 		 919 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 879 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1309  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 206 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000148999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 959 aa  51.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  32.56 
 
 		 884 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1223  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 907 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  29.74 
 
 		 1141 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  42.86 
 
 		 919 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  36.75 
 
 		 921 aa  50.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  32.78 
 
 		 541 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2282  two component LuxR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 199 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203996 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 213 aa  50.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3616  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 923 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 937 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.08 
 
 		 1150 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  30.56 
 
 		 937 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  30.56 
 
 		 937 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.4 
 
 		 1023 aa  49.7  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0091  regulatory protein LuxR  43.4 
 
 		 410 aa  49.3  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3716  LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 443 aa  49.3  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  22.99 
 
 		 1227 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.02 
 
 		 959 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  33.63 
 
 		 198 aa  49.3  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  33.83 
 
 		 981 aa  48.9  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 919 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 		 919 aa  48.9  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  36.63 
 
 		 862 aa  49.3  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1969  two component LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 199 aa  48.9  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0986563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.64 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4015  response regulator receiver protein  34.26 
 
 		 216 aa  48.5  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  30.16 
 
 		 919 aa  48.9  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2108  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  48.5  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 1148 aa  48.5  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 240 aa  48.5  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1300  transcriptional regulator, LuxR family  30.15 
 
 		 910 aa  48.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 921 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  35.9 
 
 		 921 aa  48.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3365  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.26 
 
 		 216 aa  48.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 909 aa  48.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  31.06 
 
 		 918 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5778  cyclic nucleotide-binding protein  44 
 
 		 353 aa  48.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.714206 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3406  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.588591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 221 aa  47.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  35.16 
 
 		 946 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1883  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 215 aa  47.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1446  response regulator receiver protein  44 
 
 		 210 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0398792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  27.07 
 
 		 893 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0892  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  45.83 
 
 		 896 aa  47.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.311866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1314  transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 204 aa  47.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.404844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  48 
 
 		 204 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1880  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  47.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3729  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.91 
 
 		 214 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3592  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 235 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 216 aa  47.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>