290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1619 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 855 aa  1647    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  41.93 
 
 		 947 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.3 
 
 		 951 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 998 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 		 932 aa  218  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  44.48 
 
 		 948 aa  207  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  40.91 
 
 		 960 aa  198  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  43.82 
 
 		 946 aa  185  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 974 aa  177  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 940 aa  168  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  34.97 
 
 		 943 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  40.34 
 
 		 952 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  39.12 
 
 		 947 aa  137  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  31.56 
 
 		 925 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 1015 aa  95.5  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 877 aa  94.7  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 994 aa  94  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 919 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  28.68 
 
 		 919 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 908 aa  87.4  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 1151 aa  87  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  32.18 
 
 		 1029 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 927 aa  84.3  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  31.94 
 
 		 855 aa  84.3  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.82 
 
 		 1805 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.19 
 
 		 919 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  32 
 
 		 1022 aa  83.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  30.65 
 
 		 1712 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 		 1340 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 1141 aa  80.1  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  24.05 
 
 		 1934 aa  79.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 963 aa  79.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  32.64 
 
 		 943 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 		 909 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  29.76 
 
 		 1029 aa  78.6  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  31.45 
 
 		 1235 aa  78.2  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.33 
 
 		 723 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2696  transcriptional regulator, LuxR family  32.19 
 
 		 931 aa  77.8  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704955  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.33 
 
 		 1149 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.82 
 
 		 1067 aa  77.4  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.26 
 
 		 1146 aa  77.4  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.9 
 
 		 1147 aa  77  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1148 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  32.16 
 
 		 1139 aa  75.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 1400 aa  75.5  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1015  SARP family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 1216 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.15 
 
 		 900 aa  75.1  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.47 
 
 		 1666 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.68 
 
 		 2017 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 		 1403 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  28.46 
 
 		 916 aa  73.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 1942 aa  73.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30 
 
 		 1663 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  33.22 
 
 		 884 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  32.07 
 
 		 904 aa  73.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.54 
 
 		 1339 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 973 aa  72.4  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 1104 aa  72.4  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.22 
 
 		 1089 aa  72.8  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  28.99 
 
 		 1054 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 1141 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  32.62 
 
 		 927 aa  71.6  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 1141 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  29.83 
 
 		 1320 aa  71.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  30 
 
 		 1833 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.62 
 
 		 983 aa  70.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.89 
 
 		 2303 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.22 
 
 		 1808 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  30.03 
 
 		 1122 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  28.01 
 
 		 1685 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 1013 aa  68.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  32.35 
 
 		 1697 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.21 
 
 		 1468 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.05 
 
 		 1080 aa  68.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  27.61 
 
 		 993 aa  68.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 1141 aa  68.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  30.22 
 
 		 1126 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  24.45 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.28 
 
 		 1013 aa  67.8  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  30.42 
 
 		 954 aa  67.8  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  28.96 
 
 		 1668 aa  67.8  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.49 
 
 		 2272 aa  67.8  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  31.72 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  28.12 
 
 		 1163 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  32.83 
 
 		 1321 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  31.16 
 
 		 955 aa  67.4  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.03 
 
 		 1118 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  28.63 
 
 		 1685 aa  67  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 1089 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  33.91 
 
 		 938 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  22.18 
 
 		 2051 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  31.2 
 
 		 929 aa  66.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  26.8 
 
 		 1143 aa  65.9  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.3 
 
 		 1850 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.91 
 
 		 1055 aa  65.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  24.71 
 
 		 1908 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  31.69 
 
 		 956 aa  65.5  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  31.08 
 
 		 1383 aa  65.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  27.92 
 
 		 1685 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  30.98 
 
 		 999 aa  64.7  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>