More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4714 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 929 aa  1778    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  33.65 
 
 		 901 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4051  hypothetical protein  27.54 
 
 		 643 aa  102  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 1151 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.97 
 
 		 1339 aa  85.1  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.68 
 
 		 1146 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 963 aa  80.5  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  34.24 
 
 		 981 aa  77.8  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  53.85 
 
 		 1085 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 1085 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 1137 aa  72.8  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  27.68 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  58.73 
 
 		 776 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4913  regulatory protein, LuxR  44.14 
 
 		 567 aa  72  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  49.23 
 
 		 887 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  40.71 
 
 		 758 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  42.34 
 
 		 574 aa  69.7  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  36.64 
 
 		 973 aa  69.3  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 937 aa  68.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.35 
 
 		 1122 aa  68.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  53.45 
 
 		 755 aa  67.4  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  28.29 
 
 		 872 aa  66.6  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1270  LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  28.78 
 
 		 927 aa  66.2  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  29.86 
 
 		 921 aa  65.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 881 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 881 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 876 aa  65.5  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.98 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.1 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 1030 aa  64.3  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 950 aa  63.9  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 231 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.17 
 
 		 239 aa  64.3  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2513  regulatory protein, LuxR  52.46 
 
 		 964 aa  63.9  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0733559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 222 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 209 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  45.35 
 
 		 221 aa  63.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  45.83 
 
 		 228 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.53 
 
 		 219 aa  63.2  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.07 
 
 		 1360 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  29.66 
 
 		 953 aa  62.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  46.25 
 
 		 943 aa  62.4  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 904 aa  62.4  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  44.62 
 
 		 218 aa  62.4  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  30.4 
 
 		 1139 aa  62.4  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0163  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 213 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.107009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  38.93 
 
 		 956 aa  61.6  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  39.8 
 
 		 879 aa  61.6  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 889 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.56 
 
 		 1403 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1351  response regulator receiver protein  52.83 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.631825  normal  0.574707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.85 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.48 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  51.85 
 
 		 893 aa  61.2  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  48.33 
 
 		 917 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.76 
 
 		 218 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0596  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.14 
 
 		 385 aa  60.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  0.0280718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 218 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  34.39 
 
 		 919 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.39 
 
 		 214 aa  60.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 219 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 995 aa  60.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  47.54 
 
 		 212 aa  60.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 211 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 220 aa  60.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  40.4 
 
 		 957 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 215 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6306  response regulator receiver protein  39.78 
 
 		 209 aa  60.1  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0259699  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 244 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  52.83 
 
 		 224 aa  59.7  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 932 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 212 aa  59.7  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  38.66 
 
 		 923 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  52.83 
 
 		 90 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 216 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  34.67 
 
 		 919 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  39.39 
 
 		 963 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 208 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  41.28 
 
 		 937 aa  58.9  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 894 aa  58.9  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 953 aa  58.9  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 900 aa  58.9  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 1022 aa  58.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  27.16 
 
 		 921 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  26.94 
 
 		 974 aa  58.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>