More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3097 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  73.68 
 
 		 239 aa  313  9.999999999999999e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.38 
 
 		 218 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  70.2 
 
 		 213 aa  288  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.98 
 
 		 223 aa  279  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  67.17 
 
 		 214 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.66 
 
 		 226 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  64.25 
 
 		 221 aa  277  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.44 
 
 		 219 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 220 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 215 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  63.21 
 
 		 215 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  61.32 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  63.29 
 
 		 217 aa  266  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  61.14 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  65.9 
 
 		 225 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.08 
 
 		 219 aa  261  4.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  66.16 
 
 		 223 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 211 aa  255  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  60.95 
 
 		 228 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  59.22 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  60.49 
 
 		 231 aa  245  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  60.56 
 
 		 218 aa  241  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.02 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 231 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 216 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  57.28 
 
 		 218 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.28 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  54.85 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 216 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  58.91 
 
 		 254 aa  234  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.08 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.48 
 
 		 218 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.92 
 
 		 216 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.57 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.46 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.43 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  56.37 
 
 		 214 aa  218  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.71 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.25 
 
 		 242 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.35 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.18 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 219 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  44.19 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9329  response regulator receiver protein  41.89 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 303 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.04 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.79 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  39.91 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  39.41 
 
 		 207 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.56 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.85 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.37 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  37.75 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.85 
 
 		 225 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  37.25 
 
 		 210 aa  148  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.21 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  42.52 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.95 
 
 		 239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>