203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0596 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0596  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  100 
 
 		 385 aa  729    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  0.0280718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.16 
 
 		 1146 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 963 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 973 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 		 954 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  31.55 
 
 		 1022 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.18 
 
 		 1075 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 1151 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  26.12 
 
 		 1644 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  30.57 
 
 		 1101 aa  77.8  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  28.57 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  31.18 
 
 		 1198 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 992 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  31.33 
 
 		 1054 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  29.19 
 
 		 929 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.05 
 
 		 1006 aa  72  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.6 
 
 		 1134 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  28.1 
 
 		 1885 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 		 1160 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  32.46 
 
 		 1029 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  29.52 
 
 		 1007 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.36 
 
 		 1093 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 1118 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2277  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.82 
 
 		 1797 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.947046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.23 
 
 		 1105 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.64 
 
 		 1441 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  32.09 
 
 		 983 aa  67.8  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  27.58 
 
 		 975 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.11 
 
 		 1055 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 1402 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.05 
 
 		 900 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  31.17 
 
 		 1029 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  29.87 
 
 		 965 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  26.2 
 
 		 1055 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  29.24 
 
 		 1163 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  24.69 
 
 		 1271 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  28.71 
 
 		 1122 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.43 
 
 		 1339 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.96 
 
 		 1291 aa  63.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 1400 aa  63.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  29.44 
 
 		 905 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  31.3 
 
 		 901 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.95 
 
 		 1089 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.63 
 
 		 1037 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  29.01 
 
 		 1685 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  28.3 
 
 		 1123 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.64 
 
 		 1175 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  25.64 
 
 		 1922 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  29.22 
 
 		 1685 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 1116 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.96 
 
 		 1744 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  31.11 
 
 		 966 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.96 
 
 		 1468 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  31.79 
 
 		 957 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.33 
 
 		 993 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 		 1096 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.03 
 
 		 1055 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5445  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 1161 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.77 
 
 		 967 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.06 
 
 		 1666 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  27.9 
 
 		 1141 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  32.04 
 
 		 1005 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.81 
 
 		 1422 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  27.88 
 
 		 1034 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2353  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 		 1473 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.525231 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  26.79 
 
 		 2109 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  28.65 
 
 		 963 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 		 1398 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.36 
 
 		 1794 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  27.42 
 
 		 1114 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  24.47 
 
 		 1264 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.02 
 
 		 1123 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.99 
 
 		 1050 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2863  transcriptional activator domain-containing protein  28.14 
 
 		 1132 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.99 
 
 		 1050 aa  57  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  34.59 
 
 		 981 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 1429 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2314  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 1473 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2361  adenylate/guanylate cyclase  30.15 
 
 		 1473 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.14 
 
 		 1805 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 881 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  27.4 
 
 		 1833 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3193  LuxR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 895 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  27.04 
 
 		 1311 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  27.76 
 
 		 947 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.57 
 
 		 1023 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  27.39 
 
 		 723 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  24.13 
 
 		 2272 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.12 
 
 		 1080 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.86 
 
 		 916 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.58 
 
 		 1183 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  29.32 
 
 		 955 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  20.71 
 
 		 1057 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  23.56 
 
 		 1836 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.7 
 
 		 1126 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  26.87 
 
 		 1190 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  26.68 
 
 		 1133 aa  53.9  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  28.02 
 
 		 928 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.54 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  26.93 
 
 		 1148 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>