More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2953 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2953  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 901 aa  1743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4714  transcriptional regulator, LuxR family  33.55 
 
 		 929 aa  278  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4051  hypothetical protein  32.46 
 
 		 643 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 1151 aa  114  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0446  transcriptional regulator, LuxR family  32.53 
 
 		 963 aa  105  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00639292 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  32.01 
 
 		 1075 aa  97.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  67.14 
 
 		 1085 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.38 
 
 		 1146 aa  94  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  61.19 
 
 		 1085 aa  90.5  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 1137 aa  90.9  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 882 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  55.71 
 
 		 887 aa  87.8  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  30.49 
 
 		 1339 aa  86.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  29.97 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1600  ATPase-like protein  30.37 
 
 		 1071 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 967 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 983 aa  77.4  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.65 
 
 		 1403 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  32.51 
 
 		 954 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 786 aa  70.9  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  27.43 
 
 		 919 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  54.84 
 
 		 947 aa  70.5  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  30.67 
 
 		 974 aa  70.1  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.81 
 
 		 967 aa  70.1  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  30.18 
 
 		 955 aa  70.1  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.1 
 
 		 1029 aa  68.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4797  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.2 
 
 		 1468 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 1403 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1352  tetratricopeptide TPR_4  33.64 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.24 
 
 		 981 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.89 
 
 		 1122 aa  68.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  31.1 
 
 		 1123 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3812  transcriptional regulator, LuxR family  26.07 
 
 		 927 aa  66.6  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.142204  normal  0.0901624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  30.65 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  28.05 
 
 		 1121 aa  65.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  27.35 
 
 		 947 aa  65.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  27.91 
 
 		 916 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  52.24 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  27.01 
 
 		 1006 aa  65.1  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 973 aa  65.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 920 aa  65.1  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  43.16 
 
 		 943 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  26.3 
 
 		 998 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 214 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  42.53 
 
 		 938 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  29.75 
 
 		 1160 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  38.76 
 
 		 946 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  27.81 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.57 
 
 		 222 aa  62.8  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.84 
 
 		 225 aa  62  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4710  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 973 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0640272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  34.44 
 
 		 1153 aa  62  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 938 aa  62  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 982 aa  61.6  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 956 aa  61.6  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  27.84 
 
 		 952 aa  61.6  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 951 aa  61.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  38.78 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.88 
 
 		 1126 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.55 
 
 		 1020 aa  60.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.88 
 
 		 441 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 207 aa  60.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 840 aa  60.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4471  transcriptional regulator, LuxR family  45.59 
 
 		 680 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1929  regulatory protein, LuxR  29.39 
 
 		 862 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0956  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 221 aa  60.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 950 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.04 
 
 		 1029 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3038  LuxR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  45.07 
 
 		 904 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0253  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.39 
 
 		 218 aa  60.1  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 221 aa  60.1  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 894 aa  59.3  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  40.59 
 
 		 228 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.37 
 
 		 1291 aa  59.3  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  31.51 
 
 		 970 aa  59.7  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2194  transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 937 aa  59.3  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.2 
 
 		 1150 aa  59.7  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 966 aa  59.3  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 998 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2085  LuxR family ATP-dependent transcriptional regulator  47.17 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.741908 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2836  two component LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  28.76 
 
 		 959 aa  58.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  46.03 
 
 		 917 aa  58.9  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  35.96 
 
 		 928 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 956 aa  58.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 889 aa  58.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 910 aa  58.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 1116 aa  58.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 1141 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 1141 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  40.96 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 932 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 913 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.14 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85724  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  52.54 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>