More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4054 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  44.65 
 
 
1340 aa  979    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1400 aa  2736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  46.59 
 
 
1346 aa  1023    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  42.1 
 
 
1320 aa  859    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
1289 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  34.95 
 
 
1321 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 
1422 aa  402  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  36.74 
 
 
1383 aa  396  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2717  serine/threonine protein kinase  40.31 
 
 
309 aa  161  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397979  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.48 
 
 
602 aa  141  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.94 
 
 
1160 aa  137  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  34.69 
 
 
348 aa  131  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3681  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
614 aa  130  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  31.44 
 
 
620 aa  130  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 
646 aa  126  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
1514 aa  126  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 
615 aa  126  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3726  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 
351 aa  125  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3652  serine/threonine protein kinase  34.58 
 
 
363 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29 
 
 
1089 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  31.75 
 
 
1297 aa  123  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.86 
 
 
740 aa  124  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 
612 aa  120  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3586  serine/threonine protein kinase  34.29 
 
 
363 aa  118  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
894 aa  118  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31 
 
 
919 aa  119  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  28.96 
 
 
763 aa  118  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  26.16 
 
 
662 aa  117  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2255  serine/threonine protein kinase  30.12 
 
 
450 aa  116  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.670463  normal  0.103356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 
502 aa  116  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  29.34 
 
 
618 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8472  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 
1104 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.748496 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.64 
 
 
1198 aa  114  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
1446 aa  114  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
543 aa  114  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  27.49 
 
 
1227 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.4 
 
 
614 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0224  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
1295 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4114  serine/threonine protein kinase  30.9 
 
 
513 aa  114  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0600748  normal  0.0166963 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 
1192 aa  112  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.76 
 
 
1094 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.66 
 
 
653 aa  112  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.97 
 
 
641 aa  112  5e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.61 
 
 
668 aa  112  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
657 aa  111  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 
657 aa  111  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5606  serine/threonine protein kinase  39.33 
 
 
483 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442133  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  27.29 
 
 
1134 aa  110  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.93 
 
 
613 aa  110  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  33.09 
 
 
983 aa  109  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 
852 aa  109  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.57 
 
 
598 aa  109  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  34.6 
 
 
1235 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.75 
 
 
594 aa  109  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.13 
 
 
1131 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6045  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
842 aa  108  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.82 
 
 
1081 aa  108  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.04 
 
 
1080 aa  108  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.82 
 
 
642 aa  107  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.19 
 
 
1429 aa  107  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.77 
 
 
652 aa  106  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.47 
 
 
1023 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3845  protein kinase  28.23 
 
 
531 aa  106  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111657  hitchhiker  0.000135014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  31.27 
 
 
990 aa  106  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  106  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3876  serine/threonine protein kinase  25.2 
 
 
565 aa  106  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.191754 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2094  protein kinase  30.86 
 
 
654 aa  106  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.285839  normal  0.150566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.16 
 
 
657 aa  105  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 
641 aa  105  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 
557 aa  105  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3713  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  105  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.465838  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  105  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  105  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
761 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
651 aa  105  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
996 aa  105  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34 
 
 
757 aa  105  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  105  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.23 
 
 
1295 aa  105  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27 
 
 
1598 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 
598 aa  104  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0540  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.81 
 
 
605 aa  104  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  104  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 
1415 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3904  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
657 aa  103  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.331218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4508  serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 
403 aa  103  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  27.81 
 
 
403 aa  103  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.25 
 
 
591 aa  103  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0074  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.79 
 
 
967 aa  103  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40055  Serine/threonine-protein kinase ATG1 (Autophagy-related protein 1)  25.53 
 
 
808 aa  103  3e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.334682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1172  protein kinase  28.53 
 
 
451 aa  102  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.190918  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.21 
 
 
1422 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4058  serine/threonine protein kinase  28.65 
 
 
552 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.229235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  25.98 
 
 
700 aa  102  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3878  serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 
396 aa  102  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.683762  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  28.11 
 
 
993 aa  102  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  28.88 
 
 
1805 aa  102  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.33 
 
 
707 aa  102  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  24.93 
 
 
664 aa  101  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  24.93 
 
 
664 aa  101  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>