More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2610 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 981 aa  1827    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  36.06 
 
 		 956 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.26 
 
 		 998 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  34.75 
 
 		 956 aa  162  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 1030 aa  160  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  34.12 
 
 		 954 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 723 aa  110  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  28.22 
 
 		 959 aa  109  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  30.79 
 
 		 1005 aa  108  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 983 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  32.25 
 
 		 932 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  30.08 
 
 		 1022 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.29 
 
 		 1089 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  31.5 
 
 		 992 aa  103  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.52 
 
 		 1080 aa  103  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.6 
 
 		 1081 aa  102  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  32.89 
 
 		 1055 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 950 aa  100  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25.65 
 
 		 1795 aa  98.6  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.85 
 
 		 1029 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.11 
 
 		 1141 aa  97.8  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  31.4 
 
 		 1006 aa  97.8  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  30.96 
 
 		 1075 aa  94.7  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 973 aa  94.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.5 
 
 		 1055 aa  92.8  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.07 
 
 		 1797 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27 
 
 		 1093 aa  90.5  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  28.31 
 
 		 967 aa  90.9  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  24.43 
 
 		 2051 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0744  ATPase-like protein  32.21 
 
 		 1054 aa  90.1  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  30.17 
 
 		 895 aa  89.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 993 aa  90.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  28.03 
 
 		 1055 aa  89.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1403 aa  89  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 		 1138 aa  88.6  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  28.83 
 
 		 900 aa  87  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  26.94 
 
 		 1833 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.95 
 
 		 1794 aa  87  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2931  ATPase-like protein  28.22 
 
 		 1051 aa  86.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  26.57 
 
 		 1123 aa  86.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.43 
 
 		 1291 aa  86.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  41.22 
 
 		 918 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  25.92 
 
 		 1148 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  26.84 
 
 		 1050 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.84 
 
 		 1050 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  30.88 
 
 		 1029 aa  82.8  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  26.46 
 
 		 2279 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.95 
 
 		 916 aa  82.4  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.95 
 
 		 1139 aa  82.4  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.81 
 
 		 1014 aa  82  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 		 1142 aa  82  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  29.16 
 
 		 1264 aa  82  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  30.34 
 
 		 1013 aa  80.5  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  30.29 
 
 		 965 aa  80.9  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  31.54 
 
 		 947 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  24.07 
 
 		 1046 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 1141 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  31.06 
 
 		 1013 aa  79  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  40.69 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 		 1383 aa  79  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4653  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 1148 aa  78.2  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.346184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.52 
 
 		 1122 aa  78.2  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  30.68 
 
 		 1121 aa  78.2  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  29.01 
 
 		 1089 aa  77.8  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.09 
 
 		 1105 aa  77.8  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  29.93 
 
 		 974 aa  77.4  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  26.57 
 
 		 1094 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 936 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  29.41 
 
 		 1114 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30 
 
 		 937 aa  76.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  29.3 
 
 		 922 aa  77  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  31.22 
 
 		 1146 aa  77  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  30.87 
 
 		 967 aa  76.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.46 
 
 		 1353 aa  76.3  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 919 aa  76.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  28.43 
 
 		 1666 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 1422 aa  75.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 		 956 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 		 1340 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.18 
 
 		 1149 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.92 
 
 		 1780 aa  74.7  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  30.3 
 
 		 1007 aa  75.1  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.24 
 
 		 1822 aa  74.7  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 		 970 aa  74.3  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 927 aa  74.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.37 
 
 		 1175 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 981 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  25.51 
 
 		 2272 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2591  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 552 aa  73.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000770971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 881 aa  73.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  27.86 
 
 		 927 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  30 
 
 		 1141 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  32.37 
 
 		 938 aa  73.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.8 
 
 		 1160 aa  73.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  21.3 
 
 		 2077 aa  73.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  27.78 
 
 		 1198 aa  73.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  31.85 
 
 		 909 aa  73.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 1320 aa  73.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  28.67 
 
 		 919 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 879 aa  72.4  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>