More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5315 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5315  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
965 aa  1826    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
975 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 
1007 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
1148 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  33.94 
 
 
954 aa  126  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 
1138 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  32.65 
 
 
1151 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.58 
 
 
1175 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  32.35 
 
 
1151 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  32.24 
 
 
1022 aa  116  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 
1360 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.29 
 
 
1141 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  30.66 
 
 
992 aa  111  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0361  LuxR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
973 aa  110  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.6 
 
 
1055 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  29.61 
 
 
967 aa  105  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.62 
 
 
1029 aa  104  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  28.41 
 
 
1264 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  32.67 
 
 
966 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
1298 aa  103  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.9 
 
 
1117 aa  101  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.49 
 
 
1013 aa  100  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.9 
 
 
1139 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.81 
 
 
1094 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.92 
 
 
1080 aa  100  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.44 
 
 
1081 aa  98.6  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  24.22 
 
 
1093 aa  96.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  25.77 
 
 
1160 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.49 
 
 
1122 aa  96.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.58 
 
 
959 aa  95.1  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 
983 aa  95.1  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.55 
 
 
1149 aa  94.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.95 
 
 
1014 aa  92.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
1402 aa  91.3  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
1403 aa  90.5  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.91 
 
 
1142 aa  90.1  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.83 
 
 
1050 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.83 
 
 
1050 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
1063 aa  90.1  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  29.25 
 
 
1333 aa  89.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  25.33 
 
 
1295 aa  89.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  32.45 
 
 
900 aa  89.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  31.12 
 
 
1055 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  28.41 
 
 
713 aa  88.6  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.33 
 
 
1089 aa  87.8  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.13 
 
 
1134 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.61 
 
 
1116 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 
1398 aa  87.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.45 
 
 
1053 aa  87  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.08 
 
 
1422 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.7 
 
 
1429 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.45 
 
 
1123 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  32.64 
 
 
1150 aa  86.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  25.17 
 
 
1048 aa  86.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.66 
 
 
1055 aa  86.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2581  transcriptional activator domain-containing protein  26.8 
 
 
1183 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.808302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  29.65 
 
 
916 aa  84.3  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 
1105 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30.08 
 
 
1118 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4896  ATPase-like protein  32.03 
 
 
957 aa  82.8  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0338073  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30.08 
 
 
1118 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.89 
 
 
1291 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6954  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 
1005 aa  82.4  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  26.95 
 
 
993 aa  81.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  25.93 
 
 
864 aa  80.5  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 
1311 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  30.95 
 
 
1198 aa  80.9  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  27.89 
 
 
974 aa  80.1  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  30.53 
 
 
967 aa  80.1  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4205  ATPase-like protein  33.62 
 
 
963 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181289  hitchhiker  0.00519851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.28 
 
 
1227 aa  79.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  28.11 
 
 
1034 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.6 
 
 
1403 aa  77.8  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  26.51 
 
 
1151 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  25.6 
 
 
1020 aa  77.4  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  34.41 
 
 
1075 aa  77  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  27.64 
 
 
1118 aa  76.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  29.09 
 
 
1006 aa  75.5  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.23 
 
 
1146 aa  74.3  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  25.38 
 
 
1015 aa  73.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3785  ATPase-like protein  30.46 
 
 
937 aa  74.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.114558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  28.41 
 
 
998 aa  73.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5676  transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 
953 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1340 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  29.67 
 
 
955 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2610  transcriptional regulator, LuxR family  31.77 
 
 
981 aa  72.4  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.701031  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.76 
 
 
852 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  31.15 
 
 
1123 aa  72.8  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.95 
 
 
1141 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.95 
 
 
1141 aa  72.4  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 
1046 aa  72  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  28.14 
 
 
940 aa  72  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2785  transcriptional regulator, LuxR family  27.27 
 
 
1013 aa  72  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  25.52 
 
 
1037 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4600  ATPase-like protein  31.04 
 
 
963 aa  70.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  22.36 
 
 
1774 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.14 
 
 
1668 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.68 
 
 
1141 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1046  transcriptional activator domain protein  26.73 
 
 
1143 aa  69.7  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.203225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 
1644 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>