More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5590 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5590  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 
940 aa  1778    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.508462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5782  transcriptional regulator, LuxR family  39.85 
 
 
974 aa  372  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239906  normal  0.713448 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  37.77 
 
 
951 aa  336  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  35.95 
 
 
998 aa  328  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3644  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 
946 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.690733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0554  transcriptional regulator, LuxR family  37.87 
 
 
948 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.585074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1429  transcriptional regulator, LuxR family  34.99 
 
 
932 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4558  transcriptional regulator, LuxR family  37.47 
 
 
952 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.025168  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1434  transcriptional regulator, LuxR family  37.41 
 
 
943 aa  261  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.271758  normal  0.860557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.91 
 
 
947 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 
947 aa  218  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  34.85 
 
 
960 aa  212  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
877 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2761  regulatory protein, LuxR  27.98 
 
 
943 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.208507  hitchhiker  0.00706127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1619  Tetratricopeptide TPR_4  35.84 
 
 
855 aa  144  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0543738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1178  transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 
1104 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00127631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
919 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  27.1 
 
 
919 aa  110  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  32.26 
 
 
928 aa  106  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  30.37 
 
 
927 aa  105  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  30.99 
 
 
955 aa  101  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  31.65 
 
 
928 aa  100  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29900  transcriptional regulator, luxR family  32.17 
 
 
855 aa  99  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 
904 aa  98.2  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 
956 aa  97.8  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2729  regulatory protein LuxR  33.07 
 
 
892 aa  95.5  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.805372  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.77 
 
 
1146 aa  94.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 
1015 aa  94  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5142  transcriptional regulator, LuxR family  29.68 
 
 
953 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  27.98 
 
 
925 aa  93.2  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  30.61 
 
 
1118 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  32.75 
 
 
913 aa  89.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1416  SARP family transcriptional regulator  28.5 
 
 
1141 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1434  SARP family transcriptional regulator  28.5 
 
 
1141 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 
925 aa  88.2  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0265  transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 
946 aa  88.2  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693441  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2276  transcriptional regulator, LuxR family  31.41 
 
 
928 aa  87.4  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.169085  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2594  transcriptional regulator, LuxR family  34.69 
 
 
920 aa  86.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  31.72 
 
 
983 aa  86.3  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  26.64 
 
 
1122 aa  86.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  29.22 
 
 
1123 aa  85.9  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1470  SARP family transcriptional regulator  28.27 
 
 
1141 aa  85.9  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  27.26 
 
 
876 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5436  transcriptional regulator, LuxR family  29.79 
 
 
959 aa  84.7  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5002  regulatory protein, LuxR  30.88 
 
 
940 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4682  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 
940 aa  84.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  25.5 
 
 
1134 aa  84.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4595  transcriptional regulator, LuxR family  37.06 
 
 
995 aa  83.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1863  regulatory protein, LuxR  28.31 
 
 
919 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12017  normal  0.973352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4923  LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
937 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.360996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5012  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 
937 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6794  transcriptional regulator  31.32 
 
 
723 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5305  regulatory protein, LuxR  34.32 
 
 
937 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0072  LuxR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
1000 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.996458  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  32.97 
 
 
918 aa  81.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4833  LuxR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
994 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.010143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  30.08 
 
 
923 aa  80.5  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  32.76 
 
 
1034 aa  80.9  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5143  transcriptional regulator, LuxR family  33.81 
 
 
903 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.497829  normal  0.980659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  31.87 
 
 
884 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  29.76 
 
 
1123 aa  79.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  28.87 
 
 
1022 aa  79.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3297  transcriptional regulator, LuxR family  28.94 
 
 
908 aa  79.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.19391  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  30.51 
 
 
956 aa  79  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  28.3 
 
 
1029 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5780  ATPase-like protein  33.77 
 
 
884 aa  78.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.673084  normal  0.283038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  27.44 
 
 
1190 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3610  transcriptional regulator, LuxR family  30.03 
 
 
953 aa  78.2  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0761  LuxR family transcriptional regulator  25.21 
 
 
881 aa  77.8  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4236  transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 
905 aa  77.8  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427598  normal  0.524249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3437  regulatory protein LuxR  29.22 
 
 
955 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.756741  normal  0.0840262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  27.35 
 
 
1151 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  34.57 
 
 
879 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  26.59 
 
 
786 aa  77.4  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  31.78 
 
 
934 aa  77.4  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.19 
 
 
1160 aa  76.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4504  regulatory protein, LuxR  30.49 
 
 
929 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.24 
 
 
1023 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3369  transcriptional regulator, LuxR family  29.33 
 
 
872 aa  75.9  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5653  regulatory protein, LuxR  31.64 
 
 
921 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794643  normal  0.376605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.59 
 
 
1055 aa  75.1  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.53 
 
 
992 aa  74.7  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7187  transcriptional regulator  28.3 
 
 
1198 aa  73.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  30.04 
 
 
977 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2286  regulatory protein LuxR  39.47 
 
 
961 aa  73.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  31.25 
 
 
919 aa  72.8  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0780  LuxR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
921 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0795  regulatory protein, LuxR  29.07 
 
 
921 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397823  normal  0.131546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  28.98 
 
 
954 aa  72.8  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  22.79 
 
 
1774 aa  72  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  29.05 
 
 
900 aa  72  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  29.64 
 
 
975 aa  71.6  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0415  transcriptional regulator, LuxR family  32.83 
 
 
911 aa  71.6  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4275  transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 
894 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5916  transcriptional regulator, LuxR family  26.98 
 
 
864 aa  71.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0776  regulatory protein, LuxR  28.82 
 
 
921 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
881 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
881 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  28.07 
 
 
1013 aa  70.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8714  response regulator receiver protein  30.79 
 
 
936 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>