More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2406 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 852 aa  1699    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.2 
 
 		 1198 aa  174  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.08 
 
 		 1295 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1238 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.08 
 
 		 782 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.84 
 
 		 1429 aa  145  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 1298 aa  141  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  26.06 
 
 		 1142 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  23.6 
 
 		 1123 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1313 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1060 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.25 
 
 		 1422 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.83 
 
 		 1403 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.97 
 
 		 1291 aa  124  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  26.8 
 
 		 985 aa  124  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 1101 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  23.56 
 
 		 1093 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.58 
 
 		 1080 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.69 
 
 		 1094 aa  120  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  27.25 
 
 		 1289 aa  117  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.6 
 
 		 1160 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.51 
 
 		 1081 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1526 aa  116  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1863  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 		 1422 aa  114  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.78 
 
 		 991 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  22.88 
 
 		 1271 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  26.68 
 
 		 1320 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.27 
 
 		 1089 aa  108  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 1063 aa  107  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.07 
 
 		 2145 aa  106  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1025 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 1015 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 1346 aa  104  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 1400 aa  104  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.67 
 
 		 1360 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1550 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 1340 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 1450 aa  101  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 412 aa  101  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  29.52 
 
 		 490 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  27.97 
 
 		 816 aa  100  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.89 
 
 		 1266 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 828 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  22.37 
 
 		 1139 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 957 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.16 
 
 		 1914 aa  95.9  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.48 
 
 		 1151 aa  95.1  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 		 1063 aa  95.5  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 		 1403 aa  95.1  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  23.47 
 
 		 1151 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2035  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 1383 aa  94.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.13 
 
 		 1175 aa  94.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.26 
 
 		 1141 aa  93.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.85 
 
 		 609 aa  92.8  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 1261 aa  92.8  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  24.59 
 
 		 941 aa  90.5  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  24.42 
 
 		 1204 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.67 
 
 		 755 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 1048 aa  88.2  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.67 
 
 		 1226 aa  88.2  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  22.67 
 
 		 1148 aa  88.2  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  24.84 
 
 		 1105 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.62 
 
 		 1441 aa  86.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 343 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  20.17 
 
 		 1147 aa  86.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1714 aa  86.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 408 aa  86.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3487  serine/threonine protein kinase  26.02 
 
 		 1341 aa  85.1  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  29.51 
 
 		 999 aa  84.3  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.17 
 
 		 1285 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.53 
 
 		 1009 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 571 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  24.13 
 
 		 1138 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.74 
 
 		 1180 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 968 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1092  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.16 
 
 		 1117 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.38 
 
 		 689 aa  82.4  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  24.18 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  28.42 
 
 		 834 aa  82.8  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  20.05 
 
 		 1826 aa  82.4  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1246  transcriptional regulator  23.92 
 
 		 1020 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.571861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  24.75 
 
 		 1134 aa  81.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 1311 aa  81.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 979 aa  80.9  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 1162 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  30 
 
 		 740 aa  80.9  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 714 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5515  serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 		 1302 aa  80.1  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.825294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1162 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  22.78 
 
 		 1227 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 760 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  28.18 
 
 		 621 aa  78.2  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.52 
 
 		 1149 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1404 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1285 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  26.11 
 
 		 1029 aa  77  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  23.39 
 
 		 1122 aa  77.4  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>