More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3705 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1245  NB-ARC domain-containing protein  65.44 
 
 		 848 aa  946    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1450 aa  2858    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  37.96 
 
 		 1104 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  33.43 
 
 		 782 aa  318  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  35.47 
 
 		 941 aa  294  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  32.82 
 
 		 1914 aa  278  6e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.77 
 
 		 985 aa  265  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  32.87 
 
 		 1060 aa  246  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.33 
 
 		 991 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  23.35 
 
 		 1238 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  30.42 
 
 		 1266 aa  221  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1714 aa  201  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1313 aa  182  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1261 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1596 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.97 
 
 		 2145 aa  145  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 412 aa  144  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.65 
 
 		 957 aa  142  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.69 
 
 		 1056 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.87 
 
 		 999 aa  128  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4958  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1621 aa  128  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  25.04 
 
 		 872 aa  122  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  31.89 
 
 		 639 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 1279 aa  121  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1526 aa  119  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 1101 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 1048 aa  118  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 343 aa  115  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.64 
 
 		 1009 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  29.79 
 
 		 828 aa  113  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  30.03 
 
 		 438 aa  112  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 1162 aa  112  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.18 
 
 		 1162 aa  111  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.79 
 
 		 1291 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  24.18 
 
 		 816 aa  111  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  26.63 
 
 		 1020 aa  106  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  29.77 
 
 		 1021 aa  106  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  28.36 
 
 		 340 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28 
 
 		 609 aa  104  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  25.08 
 
 		 2327 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  23.91 
 
 		 975 aa  103  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  28.98 
 
 		 827 aa  102  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  24.68 
 
 		 830 aa  102  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 852 aa  101  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  25.03 
 
 		 981 aa  101  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1063 aa  100  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  24.86 
 
 		 834 aa  99.8  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 649 aa  99  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  26.22 
 
 		 991 aa  97.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.59 
 
 		 957 aa  97.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  26.56 
 
 		 1017 aa  95.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.74 
 
 		 636 aa  95.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  29.21 
 
 		 1022 aa  94.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  28.28 
 
 		 780 aa  92.8  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  31.93 
 
 		 1054 aa  91.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  29.2 
 
 		 971 aa  91.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  25.56 
 
 		 907 aa  90.1  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  30.39 
 
 		 943 aa  90.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.14 
 
 		 988 aa  90.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  26.54 
 
 		 1056 aa  89.4  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 1298 aa  89  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  26.45 
 
 		 490 aa  88.6  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  31.79 
 
 		 965 aa  88.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 945 aa  87.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 1108 aa  87  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1025 aa  87  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1556  NB-ARC domain protein  27.96 
 
 		 792 aa  87.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.56411  normal  0.0240441 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1550 aa  86.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 408 aa  86.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 850 aa  86.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  28.13 
 
 		 1050 aa  86.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.18 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  27.9 
 
 		 1066 aa  85.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 1319 aa  85.5  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  28.23 
 
 		 1056 aa  84.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.57 
 
 		 1022 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  27.38 
 
 		 694 aa  83.2  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  27.21 
 
 		 886 aa  83.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  26.83 
 
 		 931 aa  82.8  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.95 
 
 		 740 aa  82  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.03 
 
 		 1104 aa  82  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  30.38 
 
 		 952 aa  81.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.73 
 
 		 784 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  29.03 
 
 		 701 aa  80.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  25.56 
 
 		 1044 aa  80.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.89 
 
 		 1018 aa  80.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6259  NB-ARC domain protein  29.8 
 
 		 790 aa  80.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 1346 aa  80.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.8 
 
 		 1295 aa  79  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  32.61 
 
 		 1013 aa  78.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  18.33 
 
 		 1180 aa  79  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  25.22 
 
 		 1103 aa  79  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 1064 aa  79  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1404 aa  78.6  0.0000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34600  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 896 aa  78.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.240739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 923 aa  78.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  24.67 
 
 		 1119 aa  78.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  26.26 
 
 		 1055 aa  78.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  25.23 
 
 		 792 aa  77.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  25.62 
 
 		 689 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>