234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2397 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 571 aa  1167    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  50.7 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  48.37 
 
 		 560 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  32.54 
 
 		 976 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  32.51 
 
 		 966 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.51 
 
 		 782 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  30.81 
 
 		 947 aa  101  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  30.89 
 
 		 966 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  34.87 
 
 		 966 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  30.09 
 
 		 959 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  28.64 
 
 		 921 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  35.33 
 
 		 924 aa  91.3  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.91 
 
 		 549 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  24.05 
 
 		 650 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.05 
 
 		 991 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2145 aa  89.7  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1060 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  28.16 
 
 		 957 aa  87.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.94 
 
 		 918 aa  87.4  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 		 852 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 985 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1550 aa  80.5  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 949 aa  79.3  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1101 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 		 1313 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1238 aa  73.6  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.2 
 
 		 828 aa  73.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 1025 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 872 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  26.26 
 
 		 621 aa  72  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  23.61 
 
 		 809 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  23.49 
 
 		 1147 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3806  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 600 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0299153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.07 
 
 		 1040 aa  68.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  26.99 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.76 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  26.67 
 
 		 1009 aa  67.4  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.47 
 
 		 1266 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  23.8 
 
 		 603 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.56 
 
 		 1295 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.24 
 
 		 609 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 659 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 		 1360 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  21.68 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1261 aa  64.3  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1063 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  20.61 
 
 		 600 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.39 
 
 		 868 aa  63.9  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1092  aerobic respiration sensor-response protein; histidine protein kinase  20.83 
 
 		 584 aa  63.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.962322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 438 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  29.41 
 
 		 412 aa  63.5  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 		 923 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  26.8 
 
 		 941 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 		 412 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 752 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  21.28 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  33.09 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  27.78 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  24.85 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 725 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 698 aa  60.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 1048 aa  60.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 714 aa  59.7  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  28.11 
 
 		 822 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  22.94 
 
 		 695 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.9 
 
 		 740 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 1450 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2284  hypothetical protein  26.88 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.22 
 
 		 2413 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.465421  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.77 
 
 		 1279 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  22.86 
 
 		 928 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.86 
 
 		 1666 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  22.48 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.14 
 
 		 1441 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  26.58 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1526 aa  57.4  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 408 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.79 
 
 		 771 aa  56.2  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.24 
 
 		 1123 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  33.96 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25.21 
 
 		 971 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  30.21 
 
 		 407 aa  56.2  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0665  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.020482  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47294  predicted protein  28.17 
 
 		 777 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599773  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.3 
 
 		 1195 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.75 
 
 		 1162 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 1186 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4245  hypothetical protein  25.19 
 
 		 388 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275514  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  26.89 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 534 aa  55.1  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6439  histidine kinase  25.6 
 
 		 657 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 809 aa  54.7  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.98 
 
 		 760 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.6 
 
 		 1056 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  37.68 
 
 		 400 aa  53.9  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.39 
 
 		 560 aa  53.9  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.63 
 
 		 767 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  37.88 
 
 		 407 aa  53.9  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 568 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>