More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6069 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 659 aa  1345    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 774 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  29.35 
 
 		 782 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 		 648 aa  124  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 782 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 698 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  24.26 
 
 		 746 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  22.93 
 
 		 739 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  26.44 
 
 		 624 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 		 764 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 1060 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  25.8 
 
 		 813 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 752 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 771 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 572 aa  110  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 349 aa  109  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4873  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.38 
 
 		 348 aa  110  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5358  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 348 aa  110  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08676  hypothetical protein  24.81 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0972974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 747 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 1313 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5414  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 348 aa  107  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2784  signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 354 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 1560 aa  107  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 1093 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  23.1 
 
 		 757 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  27.89 
 
 		 985 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.25 
 
 		 2145 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.46 
 
 		 991 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.49 
 
 		 744 aa  105  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 		 693 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 892 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 3706 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 1177 aa  103  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 437 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 613 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 1654 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2408  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 1676 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1899  multisensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 462 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.970297  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.87 
 
 		 957 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 488 aa  102  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 2693 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 1093 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 382 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 732 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 1093 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  34.38 
 
 		 783 aa  101  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2086  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 756 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4526  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.41 
 
 		 381 aa  100  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.315667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 856 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 439 aa  100  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 526 aa  100  9e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 945 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 980 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0515  signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 416 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.498763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 381 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 872 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1101 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 603 aa  97.8  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 1253 aa  97.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 406 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 767 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 681 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 1051 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 749 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 964 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 1714 aa  95.5  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6649  signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 739 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 398 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1246 aa  95.5  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4364  signal transduction histidine kinase  22.34 
 
 		 807 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.217771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2907  sensory transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 492 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00657144  hitchhiker  0.0001465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.3 
 
 		 828 aa  95.1  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 771 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2362  hypothetical protein  27.03 
 
 		 449 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.514155  normal  0.0458949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3529  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 405 aa  94.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 344 aa  94  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 815 aa  94  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 551 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 1239 aa  93.6  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1550 aa  93.6  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3504  signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 585 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0759377  normal  0.354882 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.47 
 
 		 1668 aa  92.8  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  34.21 
 
 		 400 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 360 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 1390 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 347 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 723 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 414 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2279  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 392 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0130228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 545 aa  91.7  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 790 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  33.82 
 
 		 1005 aa  91.3  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 400 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 382 aa  91.3  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 363 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  28.43 
 
 		 1182 aa  90.9  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>