33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0390 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  829    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  33.66 
 
 		 412 aa  250  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  33.59 
 
 		 404 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  31.13 
 
 		 421 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  31.34 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  30.27 
 
 		 408 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  29.95 
 
 		 407 aa  213  5.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  31.36 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  25.67 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  31.03 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  28.46 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  29.02 
 
 		 409 aa  193  6e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  31.4 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  28.71 
 
 		 409 aa  184  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  29.14 
 
 		 409 aa  177  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  26.73 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.39 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  38.82 
 
 		 167 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  46.34 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  44.19 
 
 		 169 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 947 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  43.04 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.58 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 921 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  43.94 
 
 		 966 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  41.79 
 
 		 966 aa  55.1  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 571 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.71 
 
 		 918 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 545 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.13 
 
 		 549 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  37.31 
 
 		 959 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 966 aa  45.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 560 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>