32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1855 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  841    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  42.82 
 
 		 410 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  41.4 
 
 		 407 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  39 
 
 		 403 aa  292  6e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  38.06 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  39.04 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  37.12 
 
 		 404 aa  277  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  34.72 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  37.46 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  36.87 
 
 		 409 aa  246  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  33.25 
 
 		 412 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  31.07 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  29.88 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  29.8 
 
 		 408 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  30.12 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  29.14 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.32 
 
 		 398 aa  167  4e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  48.34 
 
 		 167 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  44.7 
 
 		 155 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  49.44 
 
 		 169 aa  100  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  24.5 
 
 		 966 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  26.96 
 
 		 924 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 947 aa  58.9  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.34 
 
 		 976 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  24.26 
 
 		 959 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.31 
 
 		 918 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  25.9 
 
 		 921 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 		 571 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  32.86 
 
 		 966 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  23.36 
 
 		 966 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  31.67 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 560 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>