37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2054 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  833    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  62.96 
 
 		 407 aa  502  1e-141  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  52.08 
 
 		 409 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  50.25 
 
 		 403 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  48.52 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  47.77 
 
 		 409 aa  362  6e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  49.72 
 
 		 356 aa  352  5e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  44.75 
 
 		 412 aa  340  4e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  41.4 
 
 		 409 aa  297  3e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  38.28 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  33.17 
 
 		 411 aa  258  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  37.53 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  35.41 
 
 		 412 aa  256  7e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  34.33 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  31.93 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  62.05 
 
 		 167 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  31.36 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  33.08 
 
 		 398 aa  205  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  45.83 
 
 		 169 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 155 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  28.87 
 
 		 924 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 947 aa  73.6  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  26.04 
 
 		 966 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.08 
 
 		 976 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  29.32 
 
 		 959 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  29.44 
 
 		 921 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  29.38 
 
 		 918 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  23.65 
 
 		 966 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  25.56 
 
 		 966 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 545 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 549 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 560 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  30.84 
 
 		 623 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  30.61 
 
 		 638 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2641  hypothetical protein  31.65 
 
 		 603 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.85 
 
 		 607 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>