33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2398 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  85.63 
 
 		 404 aa  289  1e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  83.83 
 
 		 356 aa  282  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  84.24 
 
 		 409 aa  281  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  67.48 
 
 		 403 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  63.8 
 
 		 407 aa  214  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  62.05 
 
 		 407 aa  213  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  66.27 
 
 		 409 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  51.83 
 
 		 412 aa  155  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  48.34 
 
 		 409 aa  148  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  45.12 
 
 		 421 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  56.41 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  40.24 
 
 		 413 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  44.3 
 
 		 169 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  41.83 
 
 		 410 aa  113  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  35.71 
 
 		 411 aa  106  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  38.82 
 
 		 400 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  43.33 
 
 		 408 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  31.29 
 
 		 412 aa  94.4  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  31.52 
 
 		 398 aa  86.7  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  26.95 
 
 		 966 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  28.48 
 
 		 959 aa  62.4  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  28.48 
 
 		 947 aa  61.6  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  25.48 
 
 		 921 aa  58.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  24.42 
 
 		 966 aa  58.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  23.39 
 
 		 966 aa  57  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  36.36 
 
 		 976 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  26.96 
 
 		 924 aa  55.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 571 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.38 
 
 		 918 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 549 aa  44.3  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 545 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 269 aa  41.2  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>