172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1559 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  100 
 
 		 959 aa  1930    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  32.88 
 
 		 966 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.2 
 
 		 976 aa  454  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  30.19 
 
 		 966 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  29.25 
 
 		 966 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  30.92 
 
 		 918 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  28.9 
 
 		 924 aa  395  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  27.75 
 
 		 921 aa  302  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  25.66 
 
 		 947 aa  290  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.89 
 
 		 1074 aa  251  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  22.78 
 
 		 1366 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  22.22 
 
 		 1257 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 1341 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  23.58 
 
 		 1280 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  19.49 
 
 		 1033 aa  105  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  18.52 
 
 		 1338 aa  98.2  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.216357  normal  0.0407933 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  18.73 
 
 		 1204 aa  98.2  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  19.82 
 
 		 1048 aa  97.8  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 571 aa  95.1  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  19.58 
 
 		 1031 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  26.09 
 
 		 1114 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.2 
 
 		 1526 aa  85.5  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.96 
 
 		 1093 aa  82  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  27.44 
 
 		 1370 aa  82  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  24.63 
 
 		 1334 aa  81.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  26.04 
 
 		 1363 aa  80.9  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  22.61 
 
 		 1075 aa  80.9  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4161  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 1295 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.086012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  26.21 
 
 		 1373 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  26.74 
 
 		 1335 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  25.31 
 
 		 1384 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  30.16 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  29.26 
 
 		 545 aa  78.2  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  25.69 
 
 		 1355 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  25.66 
 
 		 1005 aa  77.4  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  35 
 
 		 623 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  18.54 
 
 		 1346 aa  75.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  30.11 
 
 		 1344 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 1258 aa  74.7  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  24.78 
 
 		 1105 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  28.83 
 
 		 1306 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  27.8 
 
 		 1298 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  25.44 
 
 		 1418 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  23.19 
 
 		 1347 aa  72.4  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  27.59 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  21.59 
 
 		 1086 aa  72  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  33.75 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  32.5 
 
 		 1313 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  24.66 
 
 		 1366 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  23.29 
 
 		 1340 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  24.41 
 
 		 1316 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  23.16 
 
 		 1407 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  29.32 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  30.46 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  24.92 
 
 		 1373 aa  68.2  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.02 
 
 		 1342 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 		 549 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  23.56 
 
 		 1397 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  25.42 
 
 		 1374 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  29.45 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.21 
 
 		 1374 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  26.45 
 
 		 1378 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  24.31 
 
 		 1017 aa  64.7  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.54 
 
 		 1505 aa  64.7  0.000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  19.63 
 
 		 990 aa  64.7  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  19.63 
 
 		 990 aa  64.7  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2456  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.79 
 
 		 1438 aa  64.7  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  28.75 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  23.97 
 
 		 1378 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3298  sensory box protein  26.94 
 
 		 1494 aa  63.9  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.217559 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2421  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.39 
 
 		 1437 aa  64.3  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  23.93 
 
 		 1017 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  21.82 
 
 		 411 aa  63.5  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  23.37 
 
 		 1344 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  24.74 
 
 		 977 aa  62.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  24.01 
 
 		 1343 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  26.55 
 
 		 421 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  28.48 
 
 		 167 aa  62.4  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  22.55 
 
 		 1051 aa  62  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  21.82 
 
 		 1034 aa  61.2  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5363  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  25.53 
 
 		 607 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  23.49 
 
 		 1498 aa  60.1  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4624  hypothetical protein  25.53 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.706425  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1602  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.07 
 
 		 1410 aa  60.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.583296  hitchhiker  0.00283749 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2164  sensory box protein  28.78 
 
 		 1431 aa  59.3  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357073  normal  0.611751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2593  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.85 
 
 		 1436 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  28.28 
 
 		 975 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  35.87 
 
 		 1324 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.63 
 
 		 1278 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  26.47 
 
 		 1084 aa  58.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 		 1079 aa  58.9  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3101  histidine kinase  25.09 
 
 		 1037 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377571  normal  0.147743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 1226 aa  58.5  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.05 
 
 		 1388 aa  58.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  18.25 
 
 		 1278 aa  57.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  38.03 
 
 		 169 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  20.68 
 
 		 1191 aa  57  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>