34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0389 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  833    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  61.73 
 
 		 409 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  69.38 
 
 		 356 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  51.77 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  50.5 
 
 		 403 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  48.52 
 
 		 407 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  50.5 
 
 		 409 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  44.67 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  39.04 
 
 		 421 aa  296  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  36.41 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  85.63 
 
 		 167 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  34.43 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  37.12 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  34.42 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  37.09 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  33.59 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  32.99 
 
 		 398 aa  236  8e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  34.01 
 
 		 410 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  52 
 
 		 155 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  46.53 
 
 		 169 aa  119  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  27.06 
 
 		 959 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  34.23 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  28.83 
 
 		 921 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.39 
 
 		 976 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  42.86 
 
 		 966 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  26.74 
 
 		 966 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  26.57 
 
 		 924 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  25.44 
 
 		 966 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 571 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.27 
 
 		 918 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.14 
 
 		 549 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 545 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 269 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 560 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>