More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06199 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  100 
 
 		 990 aa  1976    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  100 
 
 		 990 aa  1976    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06201  Putative signal protein with GGDEF domain  40.85 
 
 		 973 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00965  Putative signal protein with GGDEF domain  40.85 
 
 		 973 aa  590  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.051643  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.05 
 
 		 965 aa  194  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  22.19 
 
 		 1054 aa  189  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  26.48 
 
 		 1004 aa  173  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  24.9 
 
 		 946 aa  167  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.16 
 
 		 1346 aa  155  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  29.8 
 
 		 1008 aa  154  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  20.67 
 
 		 1034 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  21.07 
 
 		 987 aa  149  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  21.85 
 
 		 949 aa  145  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  24.02 
 
 		 976 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  21.15 
 
 		 1276 aa  140  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  24.49 
 
 		 985 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2679  diguanylate cyclase  44.44 
 
 		 459 aa  134  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3525  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 227 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.395826  normal  0.08798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2600  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  23.04 
 
 		 977 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  39.22 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2151  diguanylate cyclase  43 
 
 		 583 aa  129  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.984421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3010  diguanylate cyclase  43.16 
 
 		 382 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2943  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.26 
 
 		 438 aa  128  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.641955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0146  diguanylate cyclase  40.61 
 
 		 645 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2157  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 372 aa  128  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 301 aa  128  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0129  GGDEF domain-containing protein  40.61 
 
 		 645 aa  126  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  38.86 
 
 		 342 aa  126  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3115  diguanylate cyclase  47.2 
 
 		 354 aa  125  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.276087 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  32.16 
 
 		 794 aa  125  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0519  diguanylate cyclase  39.18 
 
 		 631 aa  124  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.447681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0144  diguanylate cyclase  40.82 
 
 		 642 aa  125  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1357  diguanylate cyclase  47.24 
 
 		 508 aa  124  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.255633 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0157  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.86 
 
 		 917 aa  124  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0486  diguanylate cyclase  39.78 
 
 		 738 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  41.98 
 
 		 490 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  38.43 
 
 		 382 aa  124  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1357  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.75 
 
 		 901 aa  124  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000351362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  35.98 
 
 		 349 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0613  diguanylate cyclase  39.08 
 
 		 611 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1425  diguanylate cyclase  43.09 
 
 		 381 aa  123  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.71 
 
 		 557 aa  122  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2394  GGDEF domain-containing protein  38.38 
 
 		 415 aa  122  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2218  GGDEF  45.73 
 
 		 448 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3316  diguanylate cyclase  38.46 
 
 		 307 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  33.06 
 
 		 398 aa  121  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 574 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.32 
 
 		 772 aa  121  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1304  diguanylate cyclase  40.53 
 
 		 559 aa  122  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2313  response regulator  41.21 
 
 		 301 aa  121  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1733  diguanylate cyclase  44.31 
 
 		 464 aa  121  6e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546701  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1695  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.91 
 
 		 594 aa  121  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0691  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.02 
 
 		 686 aa  121  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343759  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3903  diguanylate cyclase  41.05 
 
 		 370 aa  121  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0522591 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01583  Response regulator containing a CheY-like receiver domain and a GGDEF domain  40.29 
 
 		 477 aa  121  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0536  sensory box/GGDEF domain/EAL domain protein  38.31 
 
 		 829 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0050  putative diguanylate cyclase  39.67 
 
 		 696 aa  121  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315879  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0838  diguanylate cyclase  41.62 
 
 		 332 aa  121  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.569939 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  41.36 
 
 		 490 aa  121  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 335 aa  120  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3550  diguanylate cyclase  40.7 
 
 		 559 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953301  normal  0.354246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.86 
 
 		 407 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  43.09 
 
 		 460 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0490  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.1 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.853397  normal  0.203863 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  37.26 
 
 		 555 aa  120  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  37.76 
 
 		 671 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2637  diguanylate cyclase with extracellular sensor  41.62 
 
 		 474 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.31 
 
 		 1093 aa  119  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.260436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3480  diguanylate cyclase  44.72 
 
 		 395 aa  119  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2926  diguanylate cyclase  39.49 
 
 		 250 aa  119  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4122  diguanylate cyclase  44.72 
 
 		 395 aa  119  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.302969  normal  0.519011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  42.7 
 
 		 563 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4642  PAS:GGDEF  40 
 
 		 828 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4141  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.66 
 
 		 312 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.812185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5012  diguanylate cyclase  46.82 
 
 		 510 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  41.92 
 
 		 357 aa  118  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2262  diguanylate cyclase  39.91 
 
 		 237 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0475991  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  39.89 
 
 		 867 aa  118  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  40.24 
 
 		 302 aa  118  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  42.11 
 
 		 422 aa  118  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1387  diguanylate cyclase  36.94 
 
 		 336 aa  118  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.617999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  43.93 
 
 		 437 aa  118  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  41.06 
 
 		 343 aa  118  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  46.2 
 
 		 381 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2207  diguanylate cyclase  38.05 
 
 		 735 aa  118  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0260  diguanylate cyclase  40.21 
 
 		 611 aa  118  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.832837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4589  diguanylate cyclase  44.17 
 
 		 409 aa  118  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3800  diguanylate cyclase  37.24 
 
 		 621 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1154  sensory box protein  32.83 
 
 		 340 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3381  diguanylate cyclase  38.42 
 
 		 622 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1138  diguanylate cyclase  37.79 
 
 		 345 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  39.8 
 
 		 653 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  32.38 
 
 		 714 aa  117  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  37.76 
 
 		 668 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2608  diguanylate cyclase  42.86 
 
 		 380 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3108  diguanylate cyclase  41.62 
 
 		 411 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5656  GGDEF domain-containing protein  40.61 
 
 		 629 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1149  diguanylate cyclase  43.9 
 
 		 495 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1745  diguanylate cyclase  43.53 
 
 		 401 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.597218  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1319  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.92 
 
 		 610 aa  116  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.104887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>