35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0142 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  881    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  41.38 
 
 		 413 aa  354  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  43.28 
 
 		 408 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  39.04 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  38.28 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  37.16 
 
 		 407 aa  283  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  36.27 
 
 		 412 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  36.99 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  33.67 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  31.87 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  34.72 
 
 		 409 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  37.39 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  32.01 
 
 		 412 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  31.13 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  32.45 
 
 		 409 aa  237  4e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  30.81 
 
 		 410 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  45.12 
 
 		 167 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  27.95 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  97.8  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  38.67 
 
 		 155 aa  96.7  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 947 aa  67  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  26.55 
 
 		 959 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  27.07 
 
 		 966 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 921 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.61 
 
 		 918 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  39.29 
 
 		 976 aa  54.7  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  25 
 
 		 924 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  26.09 
 
 		 966 aa  53.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 571 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5155  hypothetical protein  30.34 
 
 		 623 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  hitchhiker  0.000451709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 269 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  23.02 
 
 		 966 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  26.7 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 545 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>