34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2043 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2043  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  736    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000980864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0389  hypothetical protein  69.38 
 
 		 404 aa  499  1e-140  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000587209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0353  hypothetical protein  62.32 
 
 		 409 aa  426  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000783451  normal  0.36441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1856  hypothetical protein  54.65 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2052  hypothetical protein  51.42 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000379131  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1854  hypothetical protein  51.55 
 
 		 409 aa  355  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2054  hypothetical protein  49.72 
 
 		 407 aa  352  4e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247121  normal  0.0331118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1857  hypothetical protein  43.26 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2398  hypothetical protein  83.83 
 
 		 167 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1214  hypothetical protein  34.73 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.636618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1855  hypothetical protein  37.46 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0142  hypothetical protein  37.39 
 
 		 421 aa  247  3e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0129237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0585  hypothetical protein  33.9 
 
 		 413 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.227182  normal  0.394141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2053  regulatory protein LuxR  35.13 
 
 		 410 aa  222  6e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00334599  normal  0.0797865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0522  sigma-70, region 4 type 2  34.26 
 
 		 408 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2055  hypothetical protein  30.97 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0390  hypothetical protein  31.4 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000281987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0216  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0122145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0846  response regulator receiver domain-containing protein  52.08 
 
 		 155 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0683  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0430882  normal  0.218421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1559  two component regulator  33.75 
 
 		 959 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3526  response regulator receiver protein  24.15 
 
 		 921 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1046  transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 947 aa  64.3  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4178  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  40.91 
 
 		 976 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5110  Two component regulator three Y domain protein  25.14 
 
 		 966 aa  59.7  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58811  normal  0.312264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4457  transcriptional regulator, LuxR family  27.33 
 
 		 966 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.97 
 
 		 918 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  35.53 
 
 		 924 aa  55.5  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3632  Two component regulator three Y domain protein  26.63 
 
 		 966 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 571 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4722  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 560 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1033  TPR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 545 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6752  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.78 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 269 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>