More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4246 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4246  histidine kinase  100 
 
 		 1280 aa  2589    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.921248  normal  0.11404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1719  histidine kinase  29.2 
 
 		 1257 aa  338  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0583268  normal  0.402469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  26.96 
 
 		 1074 aa  296  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1204 aa  281  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01690  histidine kinase-response regulator hybrid protein  36.04 
 
 		 1191 aa  265  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  24.92 
 
 		 1366 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 984 aa  248  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279424  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  36.82 
 
 		 1125 aa  242  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  37.8 
 
 		 982 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  29.3 
 
 		 968 aa  240  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.17 
 
 		 1125 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1181 aa  239  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 947 aa  236  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0144  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1009 aa  234  9e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.96 
 
 		 645 aa  233  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.36 
 
 		 881 aa  233  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 873 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1873  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 923 aa  232  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.61 
 
 		 907 aa  231  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1204 aa  231  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 817 aa  231  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.92 
 
 		 1199 aa  229  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 695 aa  229  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1928  sensor histidine kinase/response regulator  32.72 
 
 		 793 aa  229  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  35 
 
 		 882 aa  229  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 		 781 aa  228  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 1070 aa  228  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 873 aa  228  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 902 aa  228  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 1055 aa  228  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 		 896 aa  228  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.95 
 
 		 785 aa  228  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 995 aa  228  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3312  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 1226 aa  225  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 		 738 aa  226  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3508  sensor histidine kinase  33.74 
 
 		 729 aa  225  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 940 aa  225  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 		 1350 aa  224  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  33.07 
 
 		 1560 aa  224  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1157 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.22 
 
 		 973 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 1763 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2154  hypothetical protein  37.36 
 
 		 786 aa  224  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0411448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.15 
 
 		 655 aa  223  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0987  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 846 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.594505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1825  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 932 aa  223  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.86 
 
 		 1596 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1353  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 1029 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.283316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 		 863 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 631 aa  222  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 898 aa  222  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.6 
 
 		 969 aa  222  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 		 1691 aa  221  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.69 
 
 		 1643 aa  221  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 813 aa  221  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  34.51 
 
 		 794 aa  221  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 866 aa  221  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0605  histidine kinase  31.72 
 
 		 1190 aa  221  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  34.38 
 
 		 666 aa  220  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0420  PAS  36.02 
 
 		 787 aa  220  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0516903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  35.82 
 
 		 1028 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 		 606 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1355  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 		 895 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.26 
 
 		 846 aa  219  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 1064 aa  219  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.65 
 
 		 777 aa  218  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 957 aa  219  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.54 
 
 		 1222 aa  219  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 717 aa  218  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 837 aa  218  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1433 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 		 827 aa  218  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 		 690 aa  218  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 969 aa  218  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0688  histidine kinase/response regulator hybrid protein  30.77 
 
 		 1179 aa  218  8e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0244  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 1066 aa  217  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  31.41 
 
 		 945 aa  217  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  32.79 
 
 		 589 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.14 
 
 		 1124 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0648  sensor protein TorS  35.52 
 
 		 984 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 		 737 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1767 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.52 
 
 		 1767 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 		 877 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 780 aa  216  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  37.77 
 
 		 2109 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 902 aa  216  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 945 aa  216  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 969 aa  215  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.99 
 
 		 1075 aa  216  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3753  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 913 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0468324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1874  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 575 aa  215  3.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.807127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 765 aa  214  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 674 aa  214  7.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3846  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 		 860 aa  214  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 827 aa  214  9e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  30.77 
 
 		 1407 aa  214  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  35.56 
 
 		 620 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 718 aa  214  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 667 aa  213  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>